RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YGL138CP53122 345 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CUL3P53202 744 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W IMO32P53219 342 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ARP4P80428 489 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W UME1Q03010 460 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TRS130Q03660 1102 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HRT3Q12347 344 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CTF3Q12748 733 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TPK1P06244 397 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RIP1P08067 215 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TCP1P12612 559 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W REV1P12689 985 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W WBP1P33767 430 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YBR056WP38081 501 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W VTC2P43585 828 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YJR039WP47107 1121 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YJR096WP47137 282 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RET3P53600 189 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ARK1P53974 638 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ARO10Q06408 635 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YDL057WQ07379 328 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.36□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SAS3P34218 831 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W GLG1P36143 616 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W BIT2P38346 545 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YEL020CP39994 560 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SET2P46995 733 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W VPS25P47142 202 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W MRK1P50873 501 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SMA1Q02651 245 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CDD1Q06549 142 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W MLH3Q12083 715 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa2.35□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SEC15P22224 910 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PRP28P23394 588 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RML2P32611 393 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W EMP70P32802 667 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CSE1P33307 960 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PPZ2P33329 710 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W FLO10P36170 1169 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W OSW5P40219 148 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ORC5P50874 479 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PGA2P53903 129 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SEG1Q04279 960 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CSM3Q04659 317 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W FUS2Q05670 677 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W NKP2Q06162 153 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SHS1Q07657 551 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ZRT2Q12436 422 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HFA1P32874 2273 aa2.34□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W MSF1P08425 469 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W VPS3P23643 1011 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YPT7P32939 208 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MIC60P36112 540 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MMS4P38257 691 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TDA3P38758 523 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CKB2P38930 258 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YGR153WP48238 217 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GPG1P53130 126 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W NRM1P53718 249 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W DCS2Q12123 353 aa2.34□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GAL4P04386 881 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W STE4P18851 423 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MUP3P38734 546 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YHR054CP38780 354 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PFS1P38872 237 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W BEM4P39011 633 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PAC2P39937 518 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PIG2P40187 538 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W VTC3Q02725 835 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W HFD1Q04458 532 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YOR389WQ08912 624 aa2.33□□□□□ -2.04
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