RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C ECM4P36156 370 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YER158CP40095 573 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CHS6P40955 746 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RAD30Q04049 632 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MRPL1Q04599 285 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ROY1Q04847 553 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MSC3Q05812 728 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CRD1Q07560 283 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C AAD4Q07747 329 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SWT1Q12104 458 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TY3A-GQ12173 290 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RBD2Q12270 262 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TAF3Q12297 353 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C APC2Q12440 853 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TY3A-IQ99219 290 aa3.8□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CLC1P17891 233 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C PXL1P36166 706 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C REG2P38232 338 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MMS4P38257 691 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C VID24P38263 362 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TCD1P38756 429 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C BEM4P39011 633 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YJR124CP47159 448 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MNT2P53059 558 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YNR040WP53736 256 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SMA1Q02651 245 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CRR1Q05790 422 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YLR413WQ06689 675 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YOR352WQ08816 343 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YIG1Q08956 461 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ACM1Q08981 209 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C DIN7Q12086 430 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YLL058WQ12198 575 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C AVL9Q12500 764 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GSC2P40989 1895 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ERV1P27882 189 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SET5P38890 526 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RGI2P40188 164 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MET28P40573 187 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MMM1P41800 426 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C LSB6P42951 607 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GLO1P50107 326 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YKE2P52553 114 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YGR111WP53265 400 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GCR2Q01722 534 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SEG1Q04279 960 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C AHC1Q12433 566 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C PMD1P32634 1753 aa3.79□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YCL002CP25565 263 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YKL151CP36059 337 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C SAP190P36123 1033 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MSG5P38590 489 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CAB2P40506 365 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YNR071CP53757 342 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YNL144CP53907 740 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YMR210WQ03649 449 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GGA1Q06336 557 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C NBL1Q3E7Y6 73 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C DAP2P18962 818 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
YKL050CYKL050C SLA2P33338 968 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C GLG1P36143 616 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C CST26P38226 397 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C RFC3P38629 340 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YIL077CP40508 320 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YIR014WP40570 242 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ASE1P50275 885 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C COG1P53079 417 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YGR066CP53242 292 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C YLR407WQ06070 228 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C BCP1Q06338 283 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TY1A-DR3Q12441 440 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C ISN1Q99312 450 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C Q0142Q9ZZW4 58 aa3.78□□□□□ -1.8
YKL050CYKL050C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.81
YKL050CYKL050C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.77□□□□□ -1.81not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms