RNA–Protein interactions for RNA: YJR130C

STR2, Transcript of Cystathionine gamma-synthase, converts cysteine into cystathionine, yeast

Gene STR2, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STR2	YJR130C	MRX1	P40050	688 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SDS3	P40505	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	INA22	P40576	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ZAP1	P47043	880 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	APL4	Q12028	832 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	VPS33	P20795	691 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CDC20	P26309	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PXA2	P34230	853 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PEX5	P35056	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YBR225W	P38321	900 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TDA11	P38854	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YJL193W	P39542	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PIG2	P40187	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TRS85	P46944	698 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YGR266W	P53326	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MRPL22	P53881	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ESBP6	P53918	673 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MUB1	Q03162	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MFB1	Q04922	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HUA2	Q12134	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RAD1	P06777	1100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HCS1	P34243	683 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ESL2	P36168	1195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
STR2	YJR130C	BAP3	P41815	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SIP4	P46954	829 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	AMA1	P50082	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ATG23	Q06671	453 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SUL2	Q12325	893 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SNT2	P53127	1403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HOM3	P10869	527 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	OPI1	P21957	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YCR015C	P25616	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	BCS1	P32839	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MAC1	P35192	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FMO1	P38866	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TMN3	P40071	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LRO1	P40345	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	GCD10	P41814	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SKP2	P42843	763 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	IDS2	P46958	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TMA16	Q08687	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PCL8	Q08966	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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