RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	TRM8	Q12009	286 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	VPS54	Q12071	889 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	DAS2	Q12084	232 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	ATG29	Q12092	213 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	PNS1	Q12412	539 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	MPD2	Q99316	277 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOD1	YJR104C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SPS1	P08458	490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ATR1	P13090	542 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	DAP2	P18962	818 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	VPS3	P23643	1011 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CLB3	P24870	427 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MET22	P32179	357 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	PET127	P32606	800 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	UGA4	P32837	571 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	LRG1	P35688	1017 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	BLI1	P35727	113 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	HES1	P35843	434 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YHR112C	P38716	378 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	BCD1	P38772	366 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MTG2	P38860	518 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YHR202W	P38887	602 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SHU2	P38957	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MBP1	P39678	833 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YER186C	P40101	306 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ATG36	P46983	293 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YGR016W	P53209	190 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ORC3	P54790	616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SLT2	Q00772	484 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	INA17	Q02888	182 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	EEB1	Q02891	456 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	UME1	Q03010	460 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TAF12	Q03761	539 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	GLO2	Q05584	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ECI1	Q05871	280 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	VPS36	Q06696	566 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ADY3	Q07732	790 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	BAG7	Q12128	409 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	NSI1	Q12457	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CYB2	P00175	591 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
SOD1	YJR104C	MER1	P16523	270 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CBP3	P21560	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MEI4	P29467	408 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ZIP1	P31111	875 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TFB1	P32776	642 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	PTR2	P32901	601 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	DOM34	P33309	386 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MIA40	P36046	403 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SPC42	P36094	363 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	NAT2	P37293	288 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ETR1	P38071	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SWC5	P38326	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RRF1	P38771	230 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YHR218W	P38899	603 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RCY1	P39531	840 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RPH1	P39956	796 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	JLP2	P40206	208 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CSM2	P40465	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YFL066C	P43538	392 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SNZ3	P43545	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	IES1	P43579	692 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SAD1	P43589	448 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	IRC5	P43610	853 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	NMD5	P46970	1048 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	BIR1	P47134	954 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	MIG2	P53035	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	TAF6	P53040	516 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RMR1	P53060	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CGR1	P53188	120 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	SNZ2	P53824	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	YNL058C	P53947	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	PEX13	P80667	386 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	NSE5	Q03718	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	ACL4	Q03771	387 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOD1	YJR104C	RAD30	Q04049	632 aa		3.57	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.4 ms