RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YIR007W	P40566	764 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	MLC1	P53141	149 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	YGR111W	P53265	400 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	AIM6	Q07716	390 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	SPE4	Q12455	300 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	YBT1	P32386	1661 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	YDR416W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	HMG2	P12684	1045 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SYN8	P31377	255 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YBL028C	P38202	106 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	JHD1	P40034	492 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YIL089W	P40500	205 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DOT5	P40553	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PXA1	P41909	870 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ZAP1	P47043	880 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TRS31	Q03337	283 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TMA16	Q08687	178 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SWT1	Q12104	458 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YPT6	Q99260	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	FBP1	P09201	348 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PRE4	P30657	266 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YPT7	P32939	208 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ERC1	P38767	581 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CHS6	P40955	746 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SSY5	P47002	699 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	NCS6	P53088	359 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SDH1	Q00711	640 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PPN1	Q04119	674 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RRT8	Q08219	342 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ATG29	Q12092	213 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GPR1	Q12361	961 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	COQ4	O13525	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SAC7	P17121	654 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MRP4	P32902	394 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SEF1	P34228	1148 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
SYF1	YDR416W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ASE1	P50275	885 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ECM18	Q04623	453 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DCI1	Q08558	271 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TCO89	Q08921	799 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SLP1	Q12232	587 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VMR1	P38735	1592 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PUT4	P15380	627 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GPT2	P36148	743 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YJL171C	P46992	396 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MSC3	Q05812	728 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SOD2	P00447	233 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SNT1	P25357	1226 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MAL33	P38157	468 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	WSS1	P38838	269 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CCT6	P39079	546 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	HST3	P53687	447 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RCM1	P53972	490 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TPP1	Q03796	238 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PEX19	Q07418	342 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VPS54	Q12071	889 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	UBX3	Q12229	455 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GAL7	P08431	366 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	FPS1	P23900	669 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ASH1	P34233	588 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73

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