RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	AVL9	Q12500	764 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DFG16	Q99234	619 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TRP3	P00937	484 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ARG3	P05150	338 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EXO70	P19658	623 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YSP3	P25036	478 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CNB1	P25296	175 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NAM9	P27929	486 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RRN6	P32786	894 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YKL133C	P36066	463 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	BMT2	P38278	337 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TSC10	P38342	320 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YHL050C	P38721	697 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RIM4	P38741	713 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YDR089W	P38966	869 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YAT2	P40017	923 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CSM2	P40465	213 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	UFE1	P41834	346 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	AGX1	P43567	385 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FMP48	P53233	369 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SLI1	P53304	468 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CWC24	P53769	259 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NIS1	P53939	407 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SEG1	Q04279	960 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GAL83	Q04739	417 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PDR8	Q06149	701 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SPH1	Q06160	661 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GSH2	Q08220	491 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PUS9	Q12069	462 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FOB1	O13329	566 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	STE3	P06783	470 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RAD10	P06838	210 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RAD24	P32641	659 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SEC61	P32915	480 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	JEN1	P36035	616 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EXO1	P39875	702 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YMR134W	P40207	237 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MAM33	P40513	266 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DAN4	P47179	1161 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RMT2	Q03305	412 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CDA1	Q06702	301 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YPR204W	Q08995	1032 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DGK1	Q12382	290 aa		3.63	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	BI4	P03879	638 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GAL10	P04397	699 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ABF1	P14164	731 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CHS2	P14180	963 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RAM1	P22007	431 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SPT10	P35208	640 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PCA1	P38360	1216 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	HSE1	P38753	452 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NEM1	P38757	446 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YHR219W	P38900	624 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YGL117W	P53133	265 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	BCP1	Q06338	283 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ARO10	Q06408	635 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NTG2	Q08214	380 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FRE5	Q08908	694 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TOP3	P13099	656 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PRP28	P23394	588 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PTC6	P25646	442 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	LYP1	P32487	611 aa		3.62	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PET127	P32606	800 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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