RNA–Protein interactions for RNA: YDR365C

ESF1, Transcript of Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene ESF1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESF1	YDR365C	YHR054C	P38780	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
ESF1	YDR365C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MET28	P40573	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ILM1	P47155	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HDA1	P53973	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MEC3	Q02574	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GIS4	Q04233	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	FAR8	Q05040	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AFI1	Q99222	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RAV1	P47104	1357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	REV3	P14284	1504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	URA3	P03962	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	VPH2	P32341	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MRPL10	P36520	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MRPL36	P36531	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TAF5	P38129	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	THI2	P38141	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RRM3	P38766	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RGI2	P40188	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
ESF1	YDR365C	SHR5	P41912	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	STB1	P42845	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MDR1	P53258	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	REG1	Q00816	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DML1	Q03652	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SOG2	Q08817	791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	THI21	Q08975	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	VPS54	Q12071	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TAF3	Q12297	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YLR302C	O13544	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	IME1	P21190	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ARG1	P22768	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CLB3	P24870	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DOA4	P32571	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SLX1	P38324	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YAR028W	P39548	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	LRO1	P40345	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	INA22	P40576	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	LCL3	P53153	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ORC4	P54791	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MFM1	Q02783	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SRT1	Q03175	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SPE4	Q12455	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MLP2	P40457	1679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NUP159	P40477	1460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GAL7	P08431	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	BIK1	P11709	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RSR1	P13856	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SDH2	P21801	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	AFT1	P22149	690 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	ITR2	P30606	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	HMX1	P32339	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SSO1	P32867	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SRB2	P34162	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	RFC3	P38629	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YJL070C	P40361	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	YJL045W	P47052	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	SSN8	P47821	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	GLO1	P50107	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	MPS2	P53159	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	NCE103	P53615	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ESF1	YDR365C	DSE4	P53753	1117 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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