RNA–Protein interactions for RNA: YDR077W

SED1, Transcript of Major stress-induced structural GPI-cell wall glycoprotein, yeastyeast

Gene SED1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1YDR077W CSN9Q03981 162 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SEC10Q06245 871 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W ALR1Q08269 859 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TRE2Q08693 809 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YLR046CQ12253 270 aa9.54□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YPR089WO13585 888 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W RHO2P06781 192 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GLN4P13188 809 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NMT1P14743 455 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W HSC82P15108 705 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W ARF2P19146 181 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NPP1P25353 742 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GEX1P25596 615 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W SSE1P32589 693 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W STE13P33894 931 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GEX2P36173 615 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W GGA2P38817 585 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YHR131CP38835 850 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W NNF2P53253 936 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W TUB4P53378 473 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W YPL109CQ02981 657 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W MCP2Q06567 569 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W APC9Q12107 265 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W STB3Q12427 513 aa9.53□□□□□ -0.88
SED1YDR077W COX6P00427 148 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W MPH2P0CD99 609 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W GAL11P19659 1081 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PWP1P21304 576 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W TRX2P22803 104 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W MF(ALPHA)2P32435 120 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W TFC3P34111 1160 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W LDB7P38210 180 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W FZO1P38297 855 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SHU2P38957 223 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W AIM14P53109 570 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W IPI3P53877 555 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W UBP2Q01476 1272 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SPP2Q02521 185 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PIR1Q03178 341 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W NHP10Q03435 203 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YMR155WQ03795 547 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YPR114WQ06107 315 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W NUT2Q06213 157 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W NUS1Q12063 375 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W MDY2Q12285 212 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YLR149CQ99296 730 aa9.52□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ABF1P14164 731 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W AMD1P15274 810 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SEC15P22224 910 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YCR099CP25657 155 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SRP72P38688 640 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W BZZ1P38822 633 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W FRT2P39734 528 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W HEM14P40012 539 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PAN6P40459 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W TES1P41903 349 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W CSN12P47130 423 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W AIF1P52923 378 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W COG1P53079 417 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W BOL2P53082 120 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ORC3P54790 616 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YDR132CQ03900 495 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W CRN1Q06440 651 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W WSC3Q12215 556 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W RMD5Q12508 421 aa9.51□□□□□ -0.89
SED1YDR077W STE2D6VTK4 431 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W REV1P12689 985 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PMA2P19657 947 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SIR1P21691 654 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W LIP5P32875 414 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SCD5P34758 872 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ACO2P39533 789 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ALG8P40351 577 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W RLP7P40693 322 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W AIM23P47015 356 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PRM1P53835 661 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YNL143CP53908 130 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W TMN2Q04562 672 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ENT4Q07872 247 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W YOL019WQ08157 551 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W FRT1Q99332 602 aa9.5□□□□□ -0.89
SED1YDR077W MNE1P24720 663 aa9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W CTP1P38152 299 aa9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W UTP9P38882 575 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W ECM1P39715 212 aa9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PRM2P40534 656 aa9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W PET130P47065 347 aa9.49□□□□□ -0.89
SED1YDR077W SPC105P53148 917 aa9.49□□□□□ -0.89
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