RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	CSR2	Q12734	1121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	GLN3	P18494	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	TFC4	P33339	1025 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	BUD16	P39988	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	CAB2	P40506	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ASK10	P48361	1146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ADD37	Q03233	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	PFA5	Q03289	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	TMA17	Q12513	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	MRPL4	P36517	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ATG23	Q06671	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	TAM41	P53230	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	SWH1	P35845	1188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	RTS1	P38903	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	YEN1	P40028	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	YJR120W	P47157	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ATG21	Q02887	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	ARP7	Q12406	477 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	EDE1	P34216	1381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	MDM31	P38880	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	FET5	P43561	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	CHO1	P08456	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YSP3	P25036	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	UBP13	P38187	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YEL068C	P39977	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	PET122	P10355	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	STV1	P37296	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	HXT9	P40885	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	PEX14	P53112	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	BOR1	P53838	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	RPB8	P20436	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SIR1	P21691	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	GID7	P25569	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SLX1	P38324	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YJL068C	P40363	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	ZAP1	P47043	880 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SWA2	Q06677	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SUL2	Q12325	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	LDB16	P25587	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	MIC60	P36112	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SPG5	P42933	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	BSC6	Q08280	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YLL056C	Q12177	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YML003W	P0CF16	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	PCA1	P38360	1216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	MAD3	P47074	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	RAP1	P11938	827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	RIT1	P23796	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	LHS1	P36016	881 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	YPI1	P43587	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	MAK10	Q02197	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0144	Q0144	CLB2	P24869	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	PET111	P08468	800 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	MRX1	P40050	688 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	RGI2	P40188	164 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	YDL218W	Q07629	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	MRS3	P10566	314 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	RRT2	P38332	387 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	ERG7	P38604	731 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	CTK2	P46962	323 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	BIK1	P11709	440 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	YDL186W	P48568	277 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	YTP1	P53584	459 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	POL3	P15436	1097 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	GUF1	P46943	645 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	YJL132W	P47014	750 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	YGL242C	P53066	181 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	SWT1	Q12104	458 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	IMA1	P53051	589 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	STP3	Q05937	343 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Q0144	Q0144	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
Q0144	Q0144	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
Q0144	Q0144	NUP100	Q02629	959 aa		4.45	□□□□□ -1.7
Q0144	Q0144	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.4 ms