RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	YSA1	Q01976	231 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YOL029C	Q08187	201 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HER1	Q12276	1246 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	COX17	Q12287	69 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MEC1	P38111	2368 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PPH22	P23595	377 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PEX1	P24004	1043 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MNE1	P24720	663 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HIR2	P32480	875 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MRP4	P32902	394 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SWE1	P32944	819 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SLD2	P34252	453 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	UBP11	P36026	717 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MRX3	P38172	270 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CTM1	P38818	585 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	AXL2	P38928	823 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TIM17	P39515	158 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FAA2	P39518	744 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NUP60	P39705	539 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TOK1	P40310	691 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NMD5	P46970	1048 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YJR030C	P47101	745 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PMT3	P47190	753 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YGL117W	P53133	265 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ALG12	P53730	551 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.54	□□□□□ -2.32	not detected
AI1	Q0050	PEX25	Q02969	394 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RSC9	Q03124	581 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YML096W	Q04489	525 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ECM7	Q06200	448 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BSP1	Q06604	576 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YDR306C	Q06640	478 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YDL218W	Q07629	317 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RTT109	Q07794	436 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YLR030W	Q07967	263 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	OPI10	Q08202	246 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ENV7	Q12003	364 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TAF10	Q12030	206 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	APM4	Q99186	491 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	AIM44	Q99299	758 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	STT4	P37297	1900 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MDM35	O60200	86 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	WHI2	P12611	486 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GLN3	P18494	730 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VPS3	P23643	1011 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MIH1	P23748	554 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	AGP1	P25376	633 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YCL002C	P25565	263 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SSH4	P32343	579 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	KRE6	P32486	720 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PET112	P33893	541 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.53	□□□□□ -2.32	not detected
AI1	Q0050	SEF1	P34228	1148 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DID4	P36108	232 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FTH1	P38310	465 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MED6	P38782	295 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VPS45	P38932	577 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CCT6	P39079	546 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VRG4	P40107	337 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ARG2	P40360	574 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TPM2	P40414	161 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YHC3	P47040	408 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HOL1	P53389	586 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FDC1	Q03034	503 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VHS1	Q03785	461 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VPS64	Q03944	604 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RTT103	Q05543	409 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PHM6	Q05637	104 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YFT2	Q06676	274 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SRL1	Q08673	210 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RAD61	Q99359	647 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DYN1	P36022	4092 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CSF1	Q12150	2958 aa		0.53	□□□□□ -2.33

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