RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591919.5

UBXN6-207, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 1,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-207ENST00000591919 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 GLTPD2A6NH11 291 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 GUCY1A2P33402 732 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 KRT40Q6A162 431 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 NYAP2Q9P242 653 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 MAP3K10Q02779 954 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 PKN1Q16512 942 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 ATL3Q6DD88 541 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 BRAPQ7Z569 592 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 WDR90Q96KV7 1748 aa21.39■■□□□ 1.02
UBXN6-207ENST00000591919 SNHG28P0DPA3 235 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 XBP1P17861 261 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SMARCA1P28370 1054 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 MKL1Q969V6 931 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 PDHBP11177 359 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 RASA3Q14644 834 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 USP48Q86UV5 1035 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 CABP5Q9NP86 173 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 HACL1Q9UJ83 578 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SCN4AP35499 1836 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 FIBPO43427 364 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 GDF11O95390 407 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 MMP1P03956 469 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SEPT2Q15019 361 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 CFAP45Q9UL16 551 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 MTMR7Q9Y216 660 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ELP1O95163 1332 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 KLRF2D3W0D1 207 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ICA1Q05084 483 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 TEPSINQ96N21 525 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 USP17L5A8MUK1 530 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 KIF28PB7ZC32 967 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 GH2P01242 217 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SCG2P13521 617 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 CYTH3O43739 400 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 MBD3O95983 291 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ATP2B2Q01814 1243 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 JAG1P78504 1218 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UBXN6-207ENST00000591919 YY1P25490 414 aa21.33■■□□□ 1
UBXN6-207ENST00000591919 EPS15P42566 896 aa21.33■■□□□ 1
UBXN6-207ENST00000591919 ZNF543Q08ER8 600 aa21.33■■□□□ 1
UBXN6-207ENST00000591919 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms