RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 NCOA7Q8NI08 942 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 CLIC6Q96NY7 704 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 ALG1Q9BT22 464 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 B4E1Z4 1266 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 ATP2B4P23634 1241 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 SP8Q8IXZ3 490 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 NBPF3Q9H094 633 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 MYO1BO43795 1136 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 CNNM3Q8NE01 707 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PPP6R2O75170 966 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PDE4BQ07343 736 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 CYP2D6P10635 497 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 PTPAQ15257 358 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 RESP18Q5W5W9 173 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 KRT40Q6A162 431 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 SLC20A2Q08357 652 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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ACTN3-203ENST00000513398 DHX58Q96C10 678 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 SENP2Q9HC62 589 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTN3-203ENST00000513398 STX10O60499 249 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 DESI2Q9BSY9 194 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SLURP2P0DP57 97 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CDC27P30260 824 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TC2NQ8N9U0 490 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 KIFC2Q96AC6 838 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 FUT8Q9BYC5 575 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CACNA1SQ13698 1873 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTN3-203ENST00000513398 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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ACTN3-203ENST00000513398 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 GYS2P54840 703 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 ZMYM6O95789 1325 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CUTAO60888 179 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 BMP6P22004 513 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 ZSCAN26Q16670 478 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 PHKBQ93100 1093 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MAP3K14Q99558 947 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 USP17L12C9JPN9 530 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 USP17L21D6R901 530 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CACNB3P54284 484 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CERS5Q8N5B7 392 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CDKL5O76039 1030 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 USP17L8P0C7I0 530 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TRDNQ13061 729 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 PICALMQ13492 652 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MTMR7Q9Y216 660 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TXLNAP40222 546 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SPECC1Q5M775 1068 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 LMAN1P49257 510 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 TRIM29Q14134 588 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTN3-203ENST00000513398 SLX4Q8IY92 1834 aa20.28■□□□□ 0.84
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