RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 MFSD14CQ5VZR4 134 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 LHX8Q68G74 356 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 HAUS7Q99871 368 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL11AQ9H165 835 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 PFASO15067 1338 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 MBD4O95243 580 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2D6P10635 497 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 BMP8BP34820 402 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 COG2Q14746 738 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 GDF15Q99988 308 aa27.22■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 COL6A1P12109 1028 aa27.21■■□□□ 1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 LPAR1Q92633 364 aa27.2■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 TANGO6Q9C0B7 1094 aa27.2■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 FLRT1Q9NZU1 646 aa27.2■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKAB2O43741 272 aa27.19■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE3CQ15386 1083 aa27.19■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.19■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.19■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 COL6A3P12111 3177 aa27.19■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 MB21D1Q8N884 522 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC17Q96LX7 622 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SH2D4AQ9H788 454 aa27.18■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 STRNO43815 780 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 MSCO60682 206 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2B2Q01814 1243 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 ICA1Q05084 483 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 C12orf60Q5U649 245 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 TMX2Q9Y320 296 aa27.17■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 AKR1B1P15121 316 aa27.16■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.16■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.16■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 NPLOC4Q8TAT6 608 aa27.16■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 IGHA2P01877 340 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK8P49336 464 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 VCPKMTQ9H867 229 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.15■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L12C9JPN9 530 aa27.14■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L21D6R901 530 aa27.14■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 DSG3P32926 999 aa27.14■■□□□ 1.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.14■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SYN1P17600 705 aa27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ADORA2AP29274 412 aa27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 DPP9Q86TI2 863 aa27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.13■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 FLOT1O75955 427 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CHGBP05060 677 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ERCC3P19447 782 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2C19P33261 490 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC26Q2I0M4 334 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 MROH8Q9H579 483 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.12■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CYBAP13498 195 aa27.11■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.11■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.11■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH4Q9Y623 1939 aa27.11■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM22K7EJ46 135 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CNGA1P29973 690 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 LRCH3Q96II8 777 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.1■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CTR9Q6PD62 1173 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPV1Q8NER1 839 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ATG4CQ96DT6 458 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 DNM1LO00429 736 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 PLS1Q14651 629 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR153Q6NV75 609 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 TDHQ8IZJ6 230 aa27.09■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.08■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRDMT1-211ENST00000495022 COBLO75128 1261 aa27.07■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.07■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms