RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 UBXN2AP68543 259 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 GJD2Q9UKL4 321 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54-208ENST00000458278 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 CCNA1P78396 465 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 COG2Q14746 738 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 GOPCQ9HD26 462 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 FOXP2O15409 715 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PDE4BQ07343 736 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 Q3C1V9 767 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 RLFQ13129 1914 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PLXNB2O15031 1838 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PEX10O60683 326 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 CNMDO75829 334 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ATP2B2Q01814 1243 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PPARAQ07869 468 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MTFR1Q15390 333 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ALX1Q15699 326 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MB21D1Q8N884 522 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 RILPL2Q969X0 211 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM227BQ96M60 508 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PORCNQ9H237 461 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 NYAP2Q9P242 653 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A0D9SFI3 127 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 CCL5P13501 91 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ELNP15502 786 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PARP14Q460N5 1801 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PRDM1O75626 825 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 FLOT1O75955 427 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 INHAP05111 366 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 GPR142Q7Z601 462 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 BTBD7Q9P203 1132 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 ZMYM6O95789 1325 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 MYH4Q9Y623 1939 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 HMGCRP04035 888 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 GJB1P08034 283 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 DSG3P32926 999 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 VPS53Q5VIR6 699 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF208Q9H0X6 261 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-208ENST00000458278 HIP1O00291 1037 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 CAPN2P17655 700 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 SDSP20132 328 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 MORN1Q5T089 497 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 USP6NLQ92738 828 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 MKL1Q969V6 931 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 TTLL1O95922 423 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 TSPY3P0CV98 308 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 TSPY8P0CW00 308 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 GJA8P48165 433 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 CEP95Q96GE4 821 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 FGAP02671 866 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 RGS2P41220 211 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 APBA2Q99767 749 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 F5H6K3 240 aa20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54-208ENST00000458278 ORC4O43929 436 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms