RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EHD4Q9H223 541 aa20■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NOVP48745 357 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NDUFA8P51970 172 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NLRP5P59047 1200 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OXER1Q8TDS5 423 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP95Q96GE4 821 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SOGA3Q5TF21 947 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CABP5Q9NP86 173 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BMP15O95972 392 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SDF4Q9BRK5 362 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IDI2Q9BXS1 227 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PFKFB1P16118 471 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHISA4Q96DD7 197 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VPS33BQ9H267 617 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DPEP1P16444 411 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPZ1Q9BXG8 430 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM75PA6NK02 468 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMARCA1P28370 1054 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STX1AQ16623 288 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIGD1Q96MW7 591 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTMR4Q9NYA4 1195 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTMR7Q9Y216 660 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF202O95125 648 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RESP18Q5W5W9 173 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC17Q96LX7 622 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLRF2D3W0D1 207 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKR1B1P15121 316 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYKP43405 635 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFIAQ12857 509 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GALNT17Q6IS24 598 aa19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM34Q9BYJ4 488 aa19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HPSEQ9Y251 543 aa19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 YDJCA8MPS7 323 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTLL1O95922 423 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHMT1P34896 483 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAPPC10P48553 1259 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPY5RQ15761 445 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHC4Q6S5L8 630 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNFRSF25Q93038 417 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPREP23469 700 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TGFB2P61812 414 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HS1BP3Q53T59 392 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANO10Q9NW15 660 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PI4KBQ9UBF8 816 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP2B1P20020 1258 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNA3P22001 575 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLD1P28340 1107 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BLIDQ8IZY5 108 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIPA1L1O43166 1804 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP100Q494V2 611 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP25Q9UHP3 1055 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HDAC9Q9UKV0 1011 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYTH3O43739 400 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLIC6Q96NY7 704 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BARHL2Q9NY43 387 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM198AQ9UFP1 575 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYH4Q9Y623 1939 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ENTPD3O75355 529 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF165P49910 485 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCP10Q12799 353 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTC38Q5R3I4 469 aa19.92■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms