RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 LPAR1Q92633 364 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 VCPKMTQ9H867 229 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNB2O15031 1838 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXP2O15409 715 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM1O75626 825 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CNMDO75829 334 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 UBXN2AP68543 259 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM227BQ96M60 508 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PORCNQ9H237 461 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 GJD2Q9UKL4 321 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 RLFQ13129 1914 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0D9SFI3 127 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK4P31152 587 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PPARAQ07869 468 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 LBX2Q6XYB7 198 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 TICAM2Q86XR7 235 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 COG2Q14746 738 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS53Q5VIR6 699 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP14Q460N5 1801 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 INHAP05111 366 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL5P13501 91 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNA1P78396 465 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE4BQ07343 736 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 BTBD7Q9P203 1132 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH4Q9Y623 1939 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD21O60216 631 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR142Q7Z601 462 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF208Q9H0X6 261 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 GOPCQ9HD26 462 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPFP49454 3210 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 FLOT1O75955 427 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2B6P20813 491 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 NYAP2Q9P242 653 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD39-201ENST00000393537 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 SDSP20132 328 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 DSG3P32926 999 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR78Q5VTH9 848 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPY3P0CV98 308 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPY8P0CW00 308 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 ALX1Q15699 326 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 ATG4CQ96DT6 458 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGCRP04035 888 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 GJB1P08034 283 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE4AP27815 886 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TFAP4Q01664 338 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 MORN1Q5T089 497 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP95Q96GE4 821 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 MB21D1Q8N884 522 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIB2Q92519 343 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 USP6NLQ92738 828 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 SHISA4Q96DD7 197 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 INCENPQ9NQS7 918 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 FGAP02671 866 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS2P41220 211 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 GJA8P48165 433 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 F5H6K3 240 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms