RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P PCL5P38794 229 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC72P39723 622 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YAT2P40017 923 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P LSM5P40089 93 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RRN7P40992 514 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP85P46673 744 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SET2P46995 733 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P KAP114P53067 1004 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P MTO1P53070 669 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IPI3P53877 555 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL143CP53908 130 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TEP1P53916 434 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG5P54781 538 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ARP4P80428 489 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR131CQ03899 556 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ERF2Q06551 359 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL036WQ08206 761 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NRT1Q08485 598 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR018CQ12185 396 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR338WQ99326 363 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P INH1P01097 85 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR1P12383 1068 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GFA1P14742 717 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC23P15303 768 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CLN1P20437 546 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YSP3P25036 478 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ROX1P25042 368 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD57P25301 460 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data2.63□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P NDI1P32340 513 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT16P32558 1035 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CNS1P33313 385 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP18P33411 251 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GMH1P36125 273 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DED81P38707 554 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL008CP38750 627 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TCD1P38756 429 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CYC2P38909 366 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SMF1P38925 575 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CKB2P38930 258 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM17P39515 158 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC9P40357 651 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HXT16P47185 567 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P COG1P53079 417 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STR3P53101 465 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P BTN2P53286 410 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GND2P53319 492 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SIW14P53965 281 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P HXT15P54854 567 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP100Q02629 959 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR160WQ03823 816 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ERV41Q04651 352 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS38Q05919 439 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR148CQ06523 435 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL073CQ08232 322 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS68Q12016 184 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SRO7Q12038 1033 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DAS2Q12084 232 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YLL056CQ12177 298 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GPR1Q12361 961 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SPS1P08458 490 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ABF1P14164 731 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P NSP1P14907 823 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P APA1P16550 321 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DAL82P21705 255 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P GID7P25569 745 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YCL068CP25593 260 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P BEM1P29366 551 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PLC1P32383 869 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P DOM34P33309 386 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STO1P34160 861 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF13P35203 478 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P PIM1P36775 1133 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM2P38241 364 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P IML3P38265 245 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P SMF2P38778 549 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P STN1P38960 494 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.62□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P RPH1P39956 796 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR134WP40207 237 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG8P40351 577 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG2P40360 574 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL012WP43580 148 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms