RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K PCL5P38794 229 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC72P39723 622 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YAT2P40017 923 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K LSM5P40089 93 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RRN7P40992 514 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP85P46673 744 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SET2P46995 733 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K KAP114P53067 1004 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K MTO1P53070 669 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K IPI3P53877 555 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL143CP53908 130 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TEP1P53916 434 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG5P54781 538 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ARP4P80428 489 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR131CQ03899 556 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ERF2Q06551 359 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL036WQ08206 761 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NRT1Q08485 598 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR018CQ12185 396 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR338WQ99326 363 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K INH1P01097 85 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PDR1P12383 1068 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GFA1P14742 717 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC23P15303 768 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CLN1P20437 546 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YSP3P25036 478 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ROX1P25042 368 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD57P25301 460 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data2.63□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K NDI1P32340 513 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SPT16P32558 1035 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CNS1P33313 385 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP18P33411 251 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GMH1P36125 273 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K DED81P38707 554 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YHL008CP38750 627 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TCD1P38756 429 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CYC2P38909 366 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SMF1P38925 575 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CKB2P38930 258 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM17P39515 158 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC9P40357 651 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT16P47185 567 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K COG1P53079 417 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K STR3P53101 465 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K BTN2P53286 410 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GND2P53319 492 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SIW14P53965 281 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT15P54854 567 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP100Q02629 959 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR160WQ03823 816 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ERV41Q04651 352 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS38Q05919 439 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR148CQ06523 435 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL073CQ08232 322 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS68Q12016 184 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SRO7Q12038 1033 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K DAS2Q12084 232 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YLL056CQ12177 298 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GPR1Q12361 961 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SPS1P08458 490 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ABF1P14164 731 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K NSP1P14907 823 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K APA1P16550 321 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL82P21705 255 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K GID7P25569 745 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YCL068CP25593 260 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K BEM1P29366 551 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PLC1P32383 869 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K DOM34P33309 386 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K STO1P34160 861 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K CTF13P35203 478 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K PIM1P36775 1133 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM2P38241 364 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K IML3P38265 245 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K SMF2P38778 549 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K STN1P38960 494 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.62□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K RPH1P39956 796 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR134WP40207 237 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG8P40351 577 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K ARG2P40360 574 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)KtW(CCA)K YFL012WP43580 148 aa2.62□□□□□ -1.99
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