RNA–Protein interactions for RNA: YOR252W

TMA16, Transcript of Protein of unknown function that associates with ribosomes, yeast

Gene TMA16, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA16	YOR252W	LCB4	Q12246	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MUP3	P38734	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	OPT1	P40897	799 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	AAD10	P47182	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PLM2	Q04383	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YKU80	Q04437	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	BAG7	Q12128	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PNS1	Q12412	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MET8	P15807	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	LAC1	P28496	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MTH1	P35198	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	HES1	P35843	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ERC1	P38767	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SLZ1	P40167	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	IME4	P41833	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YFL015C	P43578	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SPC19	Q03954	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RAD33	Q04231	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	TMN2	Q04562	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	CRN1	Q06440	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SWA2	Q06677	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PCL8	Q08966	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YCK1	P23291	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SGF29	P25554	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RTS1	P38903	757 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RPN13	O13563	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GCN4	P03069	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PMA2	P19657	947 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YBR225W	P38321	900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MSY1	P48527	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SLI1	P53304	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MRPL19	P53875	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YAT1	P80235	687 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GIS1	Q03833	894 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ARP9	Q05123	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	TCO89	Q08921	799 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	FOB1	O13329	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	PGS1	P25578	521 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	AAD3	P25612	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	PEP3	P27801	918 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	EMP70	P32802	667 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	JHD1	P40034	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
TMA16	YOR252W	CIR1	P42940	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	INN1	P53901	409 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	YNL058C	P53947	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	TIM10	P87108	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ARG7	Q04728	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	MFB1	Q04922	465 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ULA1	Q12059	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	MAL33	P38157	468 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	FLC2	P39719	783 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	YEL020C	P39994	560 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ASG1	P40467	964 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	TDA10	P42938	290 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	SGM1	P47166	707 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	DSD1	P53095	428 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	YNR061C	P53747	219 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	HRD3	Q05787	833 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	IRC10	Q08118	586 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	CTI6	Q08923	506 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	RCN2	Q12044	265 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TMA16	YOR252W	SPO11	P23179	398 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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