RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	GCV2	P49095	1034 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PPM1	Q04081	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	URC2	Q04411	772 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KAR5	Q04746	504 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MCM21	Q06675	368 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MUM3	Q08750	479 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FEX1	Q08913	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SCM3	Q12334	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TRP3	P00937	484 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CWH43	P25618	953 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CSG2	P35206	410 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHL026C	P38740	315 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PEX28	P38848	579 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	IES5	P40060	125 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PFD1	P46988	109 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ECL1	P48235	211 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TEP1	P53916	434 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YPL034W	Q03083	165 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YMR187C	Q03236	431 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SUE1	Q06524	206 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YEH1	Q07804	573 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HUA2	Q12134	243 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HSP42	Q12329	375 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AHC1	Q12433	566 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AVL9	Q12500	764 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LIP5	P32875	414 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HCS1	P34243	683 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MAC1	P35192	417 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	END3	P39013	349 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CHS6	P40955	746 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RRN7	P40992	514 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YFL066C	P43538	392 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SIP4	P46954	829 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ALT1	P52893	592 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YNL143C	P53908	130 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ESBP6	P53918	673 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SOG2	Q08817	791 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	NSL1	Q12143	216 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GAL10	P04397	699 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CCA1	P21269	546 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YPT7	P32939	208 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YIL054W	P40524	105 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MDV1	P47025	714 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YGR153W	P48238	217 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GET1	P53192	235 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AVO1	Q08236	1176 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FEX2	Q08991	375 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ARP6	Q12509	438 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APE1	P14904	514 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RAD27	P26793	382 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RAD14	P28519	371 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MYO3	P36006	1272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHR054C	P38780	354 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SAP4	P53036	818 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	UGO1	Q03327	502 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ARP10	Q04549	284 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GRS2	Q06817	618 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YOR389W	Q08912	624 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MRM1	P25270	412 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	UBC8	P28263	218 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CYM1	P32898	989 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MDJ1	P35191	511 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ETR1	P38071	380 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	EFM1	P38732	585 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DYS1	P38791	387 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CPR7	P47103	393 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ALG12	P53730	551 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YKR005C	Q02203	525 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	APC4	Q04601	652 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BCH1	Q05029	724 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YEH2	Q07950	538 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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