RNA–Protein interactions for RNA: YML080W

DUS1, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS1	YML080W	AEP1	P32493	518 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RRN3	P36070	627 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SLX1	P38324	304 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	COG2	P53271	262 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	INA17	Q02888	182 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YMR155W	Q03795	547 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	APC9	Q12107	265 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	COX5A	P00424	153 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	CIT2	P08679	460 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	APE1	P14904	514 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.43	□□□□□ -0.74	not detected
DUS1	YML080W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YME2	P32843	850 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	ECM13	P38195	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SIC1	P38634	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YHL041W	P38730	149 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	BRL1	P38770	471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	VPS25	P47142	202 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YTP1	P53584	459 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	CDC14	Q00684	551 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SPP2	Q02521	185 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RPM2	Q02773	1202 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	HDA3	Q06623	655 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	AFI1	Q99222	893 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YAK1	P14680	807 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	NMT1	P14743	455 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.42	□□□□□ -0.74	not detected
DUS1	YML080W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RAD16	P31244	790 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	VRP1	P37370	817 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	VAC8	P39968	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	HAT2	P39984	401 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SPO74	P45819	413 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YLR413W	Q06689	675 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PGC1	Q08959	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SEC15	P22224	910 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PAH1	P32567	862 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	GIP1	P38229	639 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RSC4	Q02206	625 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PET117	Q02771	107 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	TRS31	Q03337	283 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SEC10	Q06245	871 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SAN1	P22470	610 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	PHO91	P27514	894 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	BCK2	P33306	851 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	FTH1	P38310	465 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SHU2	P38957	223 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	XDJ1	P39102	459 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	AIF1	P52923	378 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	YNL115C	P53925	644 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	SPO19	Q03029	223 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	CSN9	Q03981	162 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	GLO2	Q05584	274 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	LDB18	Q07887	179 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	NSL1	Q12143	216 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	RMD5	Q12508	421 aa		10.4	□□□□□ -0.74
DUS1	YML080W	STE2	D6VTK4	431 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	ATP6	P00854	259 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	CSM1	P25651	190 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	VPH2	P32341	215 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	TOM20	P35180	183 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	STB5	P38699	743 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	BEM4	P39011	633 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	PET130	P47065	347 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	IMA1	P53051	589 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	EFM6	P53970	246 aa		10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
DUS1	YML080W	FAR10	Q06001	478 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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