RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YHR131C	P38835	850 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	CHS6	P40955	746 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	GYP8	P43570	497 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	FLC3	P53121	802 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	TIM13	P53299	105 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	NHX1	Q04121	633 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YET3	Q07451	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ADY3	Q07732	790 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	TRE2	Q08693	809 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RAD59	Q12223	238 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SLP1	Q12232	587 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YLR046C	Q12253	270 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PEX11	Q12462	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	BET2	P20133	325 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	STE13	P33894	931 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	NEM1	P38757	446 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SEO1	P39709	593 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	AIM14	P53109	570 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PEX8	P53248	589 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	NUP100	Q02629	959 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PEX15	Q08215	383 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RAD3	P06839	778 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	KEX2	P13134	814 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ATP12	P22135	325 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	GEX1	P25596	615 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	AAD3	P25612	363 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	GEX2	P36173	615 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RDH54	P38086	958 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	MRP21	P38175	177 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	DUN1	P39009	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	HST2	P53686	357 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PIR1	Q03178	341 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	TRS31	Q03337	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	VPS13	Q07878	3144 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	HSF1	P10961	833 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	AMD2	P22580	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YSP3	P25036	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	EMC1	P25574	760 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	CTF13	P35203	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SUM1	P46676	1062 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SIP4	P46954	829 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	AIM23	P47015	356 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ARH1	P48360	493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ORC3	P54790	616 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ATP25	Q03153	612 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SHE9	Q04172	456 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	STB3	Q12427	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	KCS1	Q12494	1050 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	MNE1	P24720	663 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	AEP1	P32493	518 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	GDA1	P32621	518 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YBR032W	P38223	100 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YHI9	P38765	294 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YJL107C	P42947	387 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RCF2	P53721	224 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PRM1	P53835	661 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PET117	Q02771	107 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	VPS16	Q03308	798 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YPR114W	Q06107	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YLR053C	Q12026	108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	YLR149C	Q99296	730 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	UBR1	P19812	1950 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
AMD1	YML035C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	SNT1	P25357	1226 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	DCC1	P25559	380 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	LIP5	P32875	414 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ALY1	P36117	915 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	TFA2	P36145	328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	MNN1	P39106	762 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RGI2	P40188	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	RMD8	P43620	662 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	ERP6	P53198	216 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	NNF2	P53253	936 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	BUD32	P53323	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AMD1	YML035C	BIO4	P53630	237 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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