RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	SHR5	P41912	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	VPS20	Q04272	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SOV1	Q04748	898 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	STP4	Q07351	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ACM1	Q08981	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ICL2	Q12031	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	NCR1	Q12200	1170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GIS3	Q12418	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	AHC1	Q12433	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SPE4	Q12455	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PCK1	P10963	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SNT1	P25357	1226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	LTV1	P34078	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	UGA2	P38067	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	FLR1	P38124	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	REG2	P38232	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
IKS1	YJL057C	IAH1	P41734	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YGR111W	P53265	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RTC4	P53850	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	BOP2	Q06150	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GGA1	Q06336	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	THI22	Q06490	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ULA1	Q12059	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ERG8	P24521	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	EMC1	P25574	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YME1	P32795	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	COT1	P32798	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	VID24	P38263	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	JHD1	P40034	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YJL045W	P47052	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MTC3	P53077	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PIB2	P53191	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	AQR1	P53943	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SEG1	Q04279	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ARR2	Q06597	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	UAF30	Q08747	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TPK2	P06245	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ARG1	P22768	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	STE11	P23561	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	AFG1	P32317	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ALY1	P36117	915 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YKR075C	P36155	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ATG14	P38270	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	REV7	P38927	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CAB2	P40506	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	BUD8	P41698	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ELP2	P42935	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	AAD10	P47182	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	INN1	P53901	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YNL143C	P53908	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	HDA1	P53973	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CUR1	Q06469	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	THI21	Q08975	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	IME1	P21190	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ITR1	P30605	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GLG1	P36143	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	WSS1	P38838	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YAR028W	P39548	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	EFM3	P47163	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	URC2	Q04411	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CRD1	Q07560	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GSH2	Q08220	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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