RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	EMC3	P36039	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YLF2	P38746	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NUP60	P39705	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MET28	P40573	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TRM9	P49957	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CLD1	P53264	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGR168C	P53293	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YNL115C	P53925	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SIW14	P53965	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VBA3	P25594	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PLC1	P32383	869 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TGL1	P34163	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VBA5	P36172	582 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YHL008C	P38750	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SPL2	P38839	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YJL193W	P39542	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MPH1	P40562	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SWC4	P53201	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGR066C	P53242	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	EAF1	Q06337	982 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HDA2	Q06629	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GUP2	Q08929	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	FRE1	P32791	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GDH3	P39708	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MOB1	P40484	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MET13	P53128	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COG2	P53271	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COS6	P53344	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	IES4	Q08561	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HUA2	Q12134	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RPN6	Q12377	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PCH2	P38126	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TRM5	P38793	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YJR142W	P47173	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGL108C	P53139	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	LSC2	P53312	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	AHC1	Q12433	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TRP3	P00937	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CMP2	P14747	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SCJ1	P25303	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KXD1	P53158	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MPS2	P53159	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGR053C	P53234	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TIM13	P53299	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ESBP6	P53918	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	IOC2	Q12072	812 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ERP3	Q12403	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MET4	P32389	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KTR7	P40504	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CIR2	Q08822	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MDM35	O60200	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RAD7	P06779	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SHP1	P34223	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HMT1	P38074	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	JEM1	P40358	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	THI7	Q05998	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GTT2	Q12390	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KAR1	P11927	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	BEM1	P29366	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ITR1	P30605	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MRP21	P38175	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COS8	P38723	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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