RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MRP7P12687 371 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RIT1P23796 513 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CCL1P37366 393 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YMC2P38087 329 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YER130CP39959 443 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YMR102CQ03177 834 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W TFC6Q06339 672 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ICL2Q12031 575 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YKL068W-AQ3E826 78 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PDR18P53756 1333 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W GPA1P08539 472 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MTH1P35198 433 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SDH8P38345 138 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W GND2P53319 492 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SPC98P53540 846 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ZDS2P54786 942 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SML1Q04964 104 aa5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YCR061WP25639 631 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CAB2P40506 365 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W IDS2P46958 469 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YML131WQ03102 365 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W COG4Q06096 861 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YPL216WQ08964 1102 aa5.07□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W BET2P20133 325 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CLB4P24871 460 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CDC5P32562 705 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W XRS2P33301 854 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W VPS41P38959 992 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W NOC2P39744 710 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ARB1P40024 610 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ARP5P53946 755 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MRS2Q01926 470 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W WAR1Q03631 944 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W TRS23Q03784 219 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ARA2Q04212 335 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CTT1P06115 562 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W KIN3P22209 435 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W NUP133P36161 1157 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PCH2P38126 564 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MRPL13Q02204 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W GYL1Q04322 720 aa5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.06□□□□□ -1.6not detected
PRD1YCL057W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PET123P17558 318 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W BEM3P32873 1128 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W LOT5P34234 306 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PSY4P38193 441 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RTT107P38850 1070 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W BST1P43571 1029 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W BNA1P47096 177 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SAP4P53036 818 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PIB2P53191 635 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ESF2P53743 316 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W GTR1Q00582 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W TGS1Q12052 315 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W URB1P34241 1764 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W FKS3Q04952 1785 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W UBC1P21734 215 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W DMC1P25453 334 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MAL33P38157 468 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YDL073WQ07454 984 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W APL4Q12028 832 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W NCB2Q92317 146 aa5.05□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W GSY2P27472 705 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CDC15P27636 974 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W EMP70P32802 667 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PIH1P38768 344 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SAP1P39955 897 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SMK1P41808 388 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YGL117WP53133 265 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W VPS73P53142 486 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W ATG21Q02887 496 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SUL2Q12325 893 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YOL087CQ99247 1116 aa5.04□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W AAC1P04710 309 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W PET111P08468 800 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SPC110P32380 944 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W YNL092WP53934 400 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SUB1P54000 292 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W IRC10Q08118 586 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W SSP2Q08646 371 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
PRD1YCL057W YPL150WQ12152 901 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W NUC1P08466 329 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W TPM1P17536 199 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W CDC43P18898 376 aa5.03□□□□□ -1.6
PRD1YCL057W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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