RNA–Protein interactions for RNA: Q0182

Q0182, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0182, Length 405 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0182	Q0182	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RSM24	Q03976	319 aa		12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PHO92	Q06390	306 aa		12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	HER1	Q12276	1246 aa		12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	GRR1	P24814	1151 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	SUR1	P33300	382 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	LTV1	P34078	463 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	SIC1	P38634	284 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RRM3	P38766	723 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	ERC1	P38767	581 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	FTR1	P40088	404 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	POM34	Q12445	299 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	YPT6	Q99260	215 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	ISN1	Q99312	450 aa		12.32	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	CLC1	P17891	233 aa		12.31	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	SYN8	P31377	255 aa		12.31	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	12.31	□□□□□ -0.44	not detected
Q0182	Q0182	ARP5	P53946	755 aa		12.31	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	SAC3	P46674	1301 aa		12.31	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	QCR6	P00127	147 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	MUP3	P38734	546 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	AKR1	P39010	764 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	LCL3	P53153	274 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	MAK10	Q02197	733 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	DON1	Q05610	365 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	BUD7	Q08754	746 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	SPE4	Q12455	300 aa		12.3	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	YLR415C	O13578	112 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PCH2	P38126	564 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PKP1	P40530	394 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	IDS2	P46958	469 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	YGR111W	P53265	400 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	KAP120	Q02932	1032 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	RBA50	Q04418	439 aa		12.29	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	YHR112C	P38716	378 aa		12.28	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.28	□□□□□ -0.44	not detected
Q0182	Q0182	SHE4	P51534	789 aa		12.28	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	YDR239C	Q03780	787 aa		12.28	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
Q0182	Q0182	TUP1	P16649	713 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	VPS17	P32913	551 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	TAT1	P38085	619 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	EHT1	P38295	451 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	IME4	P41833	600 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	VPS38	Q05919	439 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	ECM3	Q99252	613 aa		12.27	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	SEF1	P34228	1148 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	MIC60	P36112	540 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	WSS1	P38838	269 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	MMM1	P41800	426 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RRN5	Q02983	363 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	SOV1	Q04748	898 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	STP3	Q05937	343 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	SWT1	Q12104	458 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	YOR019W	Q99248	730 aa		12.26	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	CMC1	P36064	111 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	AGP2	P38090	596 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	MRX1	P40050	688 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	STU2	P46675	888 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	VID30	P53076	958 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	DCI1	Q08558	271 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	SWM1	Q12379	170 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	AVL9	Q12500	764 aa		12.25	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	VPS33	P20795	691 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	YIH1	P25637	258 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	CDC15	P27636	974 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	DCG1	P32460	244 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	CCT6	P39079	546 aa		12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	AFG3	P39925	761 aa		12.23	□□□□□ -0.45
Q0182	Q0182	MND2	P40577	368 aa		12.23	□□□□□ -0.45

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms