RNA–Protein interactions for RNA: Q0017

Q0017, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0017, Length 162 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0017	Q0017	BZZ1	P38822	633 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	SWD1	P39706	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	SAW1	P39735	261 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	SKP2	P42843	763 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	UBX6	P47049	396 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	POS5	Q06892	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	HES1	P35843	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	SDS22	P36047	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	SDS24	P38314	527 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	EFM2	P38347	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	YDR109C	Q04585	715 aa		4.16	□□□□□ -1.74
Q0017	Q0017	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	SND1	Q04007	877 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	SWF1	Q04629	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	ECI1	Q05871	280 aa		4.15	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	CDC23	P16522	626 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	PEX14	P53112	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	YMR254C	Q04838	102 aa		4.13	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	CBP1	P07252	654 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	HNM1	P19807	563 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	TAM41	P53230	385 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	TAH18	Q12181	623 aa		4.12	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	YBR139W	P38109	508 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	IML2	P47031	731 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	ASK10	P48361	1146 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	YLR352W	Q06479	807 aa		4.11	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	GRX4	P32642	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	MGR1	P25573	417 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	URK1	P27515	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	CUL3	P53202	744 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	CRZ1	P53968	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Q0017	Q0017	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	PCT1	P13259	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	LEU5	P38702	357 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	MSY1	P48527	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	GTB1	Q04924	702 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YLR455W	Q06188	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	MAD3	P47074	515 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YNL181W	P53878	407 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	SMA1	Q02651	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	RAD24	P32641	659 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	CAB2	P40506	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YLR049C	Q12110	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	ARP7	Q12406	477 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	BAR1	P12630	587 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YJL070C	P40361	888 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YNL234W	P53857	426 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	YML002W	P0CF17	737 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	ASI1	P54074	624 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	BSC1	Q12140	328 aa		4.04	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	RIT1	P23796	513 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	PDR3	P33200	976 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	KRE9	P39005	276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	BUD16	P39988	312 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	PHM8	P40025	321 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	ATG27	P46989	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	STP3	Q05937	343 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	MCP2	Q06567	569 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	SUL2	Q12325	893 aa		4.03	□□□□□ -1.76
Q0017	Q0017	PMS1	P14242	873 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	YSP3	P25036	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	DOS2	P54858	310 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	BAG7	Q12128	409 aa		4.02	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	PET122	P10355	254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	SIR1	P21691	654 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	STE50	P25344	346 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	TRS65	P32893	560 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	UBP13	P38187	747 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	SGF73	P53165	657 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	PFA5	Q03289	374 aa		4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	CHO1	P08456	276 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	YPK3	P38070	525 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	DJP1	P40564	432 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	ATG21	Q02887	496 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	DAP1	Q12091	152 aa		4	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
Q0017	Q0017	RIM2	P38127	377 aa		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 127.5 ms