RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.39■□□□□ 0.85
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CLN6-218ENST00000637223 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 SH2D4AQ9H788 454 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 NYAP2Q9P242 653 aa20.29■□□□□ 0.84
CLN6-218ENST00000637223 STX8Q9UNK0 236 aa20.29■□□□□ 0.84
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