RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-210ENST00000551525 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-210ENST00000551525 C6orf50Q9HD87 102 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 RCN1Q15293 331 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 FLCNQ8NFG4 579 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SMC6Q96SB8 1091 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PARVBQ9HBI1 364 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ATP10DQ9P241 1426 aa7.02□□□□□ -1.29
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