RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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PRAME-213ENST00000492657 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.71□□□□□ -0.05
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PRAME-213ENST00000492657 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 DHX58Q96C10 678 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 USP5P45974 858 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 UBASH3AP57075 661 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.066e-14■□□□□ 9.2
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PRAME-213ENST00000492657 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF25Q93038 417 aa14.7□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 ERICH4A6NGS2 130 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 SERPINC1P01008 464 aa14.7□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.69□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 GSDMDP57764 484 aa14.69□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD7Q92527 254 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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