RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023363.6

Rrn3-201, Transcript of RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rrn3, Length 3,597 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NefhP19246 1090 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Usp13Q5BKP2 858 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 PsdQ5DTT2 1024 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Prl2c1Q5SVL9 228 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Trim29Q8R2Q0 587 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 MetP16056 1379 aa11.08□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gjb4Q02738 266 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Spg7Q3ULF4 781 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Spag5Q7TME2 1165 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mettl5Q8K1A0 209 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Stk39Q9Z1W9 556 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Col3a1P08121 1464 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arhgap33Q80YF9 1305 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Bnip3O55003 187 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Grin1P35438 938 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Uri1Q3TLD5 531 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Krt39Q6IFX4 482 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Necab1Q8BG18 352 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ptrh1Q8BW00 204 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Stag1Q9D3E6 1258 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Frmd7A2AD83 703 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm10134F6ZQC6 126 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nf2P46662 596 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ckap2Q3V1H1 664 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Usp49Q6P9L4 685 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Znf131Q8K3J5 619 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 SelenooQ9DBC0 667 aa11.07□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Spocd1B1ASB6 936 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm5592Q3V0A6 857 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 BC048507Q80ZS7 89 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Terb1Q8C0V1 768 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ttc14Q9CSP9 761 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Q9D5Q8 446 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Abcb6Q9DC29 842 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rcan1Q9JHG6 198 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ssc5dQ8BV57 1371 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc27a1Q60714 646 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cyp7b1Q60991 507 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sirt2Q8VDQ8 389 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 4930548H24RikQ9D496 437 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lmbr1Q9JIT0 490 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Parp2O88554 559 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 PparaP23204 468 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arhgef2Q60875 985 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sox30Q8CGW4 782 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tspyl4Q8VD63 406 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NenfQ9CQ45 171 aa11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Otud7bB2RUR8 840 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lamb3Q61087 1168 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Epha10Q8BYG9 1007 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pde5aQ8CG03 865 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Klhl10Q9D5V2 608 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tubb4aQ9D6F9 444 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cbx6Q9DBY5 414 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Stag2O35638 1231 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gng11P61953 73 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zfp91Q62511 572 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Fam76aQ922G2 307 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Vps33aQ9D2N9 598 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cd274Q9EP73 290 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nek3Q9R0A5 511 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Apol7aB2RT54 418 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gjc1P28229 396 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ncf1Q09014 390 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ccdc51Q3URS9 406 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Clec16aQ80U30 1036 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Bbs9Q811G0 885 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ankk1Q8BZ25 745 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pus7lQ8CE46 702 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arl8aQ8VEH3 186 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nwd2Q6P5U7 1742 aa11.05□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cdc27A2A6Q5 825 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 MeiocA2AG06 965 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 MthfslL7N466 203 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kcnd1Q03719 651 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc7a1Q09143 622 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pls1Q3V0K9 630 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Jakmip3Q5DTN8 844 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kctd1Q5M956 257 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Txndc16Q7TN22 820 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dpp8Q80YA7 892 aa11.04□□□□□ -0.64
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms