Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Tubb4aQ9D6F9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Tubb4aQ9D6F9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Tubb4aQ9D6F9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,62■■■■□ 3,29
Tubb4aQ9D6F9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Tubb4aQ9D6F9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Tubb4aQ9D6F9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Tubb4aQ9D6F9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Tubb4aQ9D6F9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Tubb4aQ9D6F9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tubb4aQ9D6F9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Tubb4aQ9D6F9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Tubb4aQ9D6F9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Tubb4aQ9D6F9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Tubb4aQ9D6F9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Tubb4aQ9D6F9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Tubb4aQ9D6F9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Tubb4aQ9D6F9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tubb4aQ9D6F9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tubb4aQ9D6F9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Tubb4aQ9D6F9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Tubb4aQ9D6F9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Tubb4aQ9D6F9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Tubb4aQ9D6F9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Tubb4aQ9D6F9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Tubb4aQ9D6F9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Tubb4aQ9D6F9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Tubb4aQ9D6F9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Tubb4aQ9D6F9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Tubb4aQ9D6F9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Tubb4aQ9D6F9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Tubb4aQ9D6F9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Tubb4aQ9D6F9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Tubb4aQ9D6F9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Tubb4aQ9D6F9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Tubb4aQ9D6F9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Tubb4aQ9D6F9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Tubb4aQ9D6F9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Tubb4aQ9D6F9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Tubb4aQ9D6F9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Tubb4aQ9D6F9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Tubb4aQ9D6F9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Tubb4aQ9D6F9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Tubb4aQ9D6F9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Tubb4aQ9D6F9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Tubb4aQ9D6F9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Tubb4aQ9D6F9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Tubb4aQ9D6F9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Tubb4aQ9D6F9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Tubb4aQ9D6F9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Tubb4aQ9D6F9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Tubb4aQ9D6F9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Tubb4aQ9D6F9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Tubb4aQ9D6F9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tubb4aQ9D6F9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Tubb4aQ9D6F9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Tubb4aQ9D6F9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Tubb4aQ9D6F9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Tubb4aQ9D6F9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Tubb4aQ9D6F9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Tubb4aQ9D6F9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Tubb4aQ9D6F9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Tubb4aQ9D6F9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Tubb4aQ9D6F9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Tubb4aQ9D6F9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Tubb4aQ9D6F9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Tubb4aQ9D6F9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tubb4aQ9D6F9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tubb4aQ9D6F9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tubb4aQ9D6F9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tubb4aQ9D6F9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Tubb4aQ9D6F9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Tubb4aQ9D6F9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Tubb4aQ9D6F9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Tubb4aQ9D6F9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Tubb4aQ9D6F9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tubb4aQ9D6F9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tubb4aQ9D6F9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tubb4aQ9D6F9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tubb4aQ9D6F9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Tubb4aQ9D6F9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tubb4aQ9D6F9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tubb4aQ9D6F9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tubb4aQ9D6F9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,4 ms