Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,73■■■■□ 3,63
Gjc1P28229 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Gjc1P28229 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Gjc1P28229 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Gjc1P28229 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Gjc1P28229 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Gjc1P28229 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Gjc1P28229 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Gjc1P28229 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Gjc1P28229 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Gjc1P28229 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Gjc1P28229 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Gjc1P28229 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Gjc1P28229 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Gjc1P28229 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,97■■■□□ 2,87
Gjc1P28229 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Gjc1P28229 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Gjc1P28229 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Gjc1P28229 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Gjc1P28229 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Gjc1P28229 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Gjc1P28229 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Gjc1P28229 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Gjc1P28229 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Gjc1P28229 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Gjc1P28229 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Gjc1P28229 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Gjc1P28229 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Gjc1P28229 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Gjc1P28229 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Gjc1P28229 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Gjc1P28229 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Gjc1P28229 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gjc1P28229 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gjc1P28229 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gjc1P28229 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Gjc1P28229 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Gjc1P28229 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Gjc1P28229 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gjc1P28229 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Gjc1P28229 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Gjc1P28229 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Gjc1P28229 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Gjc1P28229 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gjc1P28229 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Gjc1P28229 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Gjc1P28229 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Gjc1P28229 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Gjc1P28229 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Gjc1P28229 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Gjc1P28229 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gjc1P28229 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gjc1P28229 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gjc1P28229 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gjc1P28229 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Gjc1P28229 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gjc1P28229 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Gjc1P28229 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gjc1P28229 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gjc1P28229 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Gjc1P28229 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gjc1P28229 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Gjc1P28229 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Gjc1P28229 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gjc1P28229 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Gjc1P28229 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gjc1P28229 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gjc1P28229 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Gjc1P28229 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Gjc1P28229 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Gjc1P28229 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Gjc1P28229 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gjc1P28229 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Gjc1P28229 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Gjc1P28229 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Gjc1P28229 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Gjc1P28229 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Gjc1P28229 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Gjc1P28229 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Gjc1P28229 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gjc1P28229 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Gjc1P28229 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gjc1P28229 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gjc1P28229 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gjc1P28229 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gjc1P28229 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gjc1P28229 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gjc1P28229 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gjc1P28229 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gjc1P28229 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gjc1P28229 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gjc1P28229 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gjc1P28229 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Gjc1P28229 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gjc1P28229 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms