RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pla2g10Q9QXX3 151 aa6.85□□□□□ -1.31
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrp2A2ARV4 4660 aa6.84□□□□□ -1.31
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa6.84□□□□□ -1.31
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9955Q8CEJ8 102 aa6.82□□□□□ -1.32
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.78□□□□□ -1.32
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PcloQ9QYX7 5068 aa6.73□□□□□ -1.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap13-1Q8K198 168 aa6.67□□□□□ -1.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CriptO70333 101 aa6.53□□□□□ -1.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC029722A0A0N4SW31 51 aa6.52□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap1-5A2A590 122 aa6.5□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10318A0A1W2P728 225 aa6.49□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12216A0A1W2P827 62 aa6.49□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Crct1Q6PAI5 102 aa6.49□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa6.48□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Romo1P60603 79 aa6.47□□□□□ -1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Herc1E9PZP8 4859 aa6.46□□□□□ -1.38
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa6.43□□□□□ -1.38
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap19-1Q925H2 87 aa6.39□□□□□ -1.39
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21887J3QQ04 176 aa6.38□□□□□ -1.39
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam229aB2KGE5 128 aa6.38□□□□□ -1.39
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm19426M0QWC7 77 aa6.36□□□□□ -1.39
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap19-3Q925H6 87 aa6.34□□□□□ -1.39
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1mQ9CR91 182 aa6.31□□□□□ -1.4
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm19402J3QJV4 266 aa6.31□□□□□ -1.4
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17402F6Z0L5 76 aa6.28□□□□□ -1.4
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ush2AQ2QI47 5193 aa6.23□□□□□ -1.41
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ZanO88799 5376 aa6.21□□□□□ -1.41
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spink7Q6IE32 76 aa6.21□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubr4A2AN08 5180 aa6.2□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr2a3Q4KL71 83 aa6.2□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa6.2□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmcn2A2AJ76 5100 aa6.19□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa6.15□□□□□ -1.42
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap1-3A2A588 173 aa6.14□□□□□ -1.43
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa6.12□□□□□ -1.43
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fat4Q2PZL6 4981 aa6.06□□□□□ -1.44
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm18596A0A1W2P860 280 aa6.02□□□□□ -1.45
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LorP18165 486 aa6.01□□□□□ -1.45
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9789Q8BIG3 52 aa5.99□□□□□ -1.45
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa5.99□□□□□ -1.45
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1jD3YUU5 139 aa5.97□□□□□ -1.45
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prm1P02319 51 aa5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mp68P56379 58 aa5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap12-1Q9Z287 130 aa5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm7735D3YX18 52 aa5.87□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Camk2n1Q6QWF9 78 aa5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm19668J3QMD1 248 aa5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap19-9aF8WH65 55 aa5.82□□□□□ -1.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap17-1A2A5X6 109 aa5.79□□□□□ -1.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa5.78□□□□□ -1.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20538F6Z9R1 75 aa5.78□□□□□ -1.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prm2P07978 107 aa5.72□□□□□ -1.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SspoQ8CG65 4998 aa5.66□□□□□ -1.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap19-2Q925I0 141 aa5.61□□□□□ -1.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1iQ9D6P5 149 aa5.6□□□□□ -1.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap9-5A2A5X3 358 aa5.59□□□□□ -1.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1a2Q9D1K4 149 aa5.55□□□□□ -1.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa5.54□□□□□ -1.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap8-1O08633 61 aa5.48□□□□□ -1.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnp1P10856 55 aa5.43□□□□□ -1.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10061D3Z714 54 aa5.42□□□□□ -1.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa5.4□□□□□ -1.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc5bE9Q5I3 4800 aa5.31□□□□□ -1.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa5.29□□□□□ -1.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6358A0A087WPH4 74 aa5.28□□□□□ -1.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mt2P02798 61 aa5.23□□□□□ -1.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1hQ9D6R3 140 aa5.22□□□□□ -1.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa5.17□□□□□ -1.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11569B1AQB1 180 aa5.08□□□□□ -1.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap22-2J3QNX6 67 aa4.9□□□□□ -1.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9112A2AI92 75 aa4.88□□□□□ -1.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1dQ9D731 133 aa4.79□□□□□ -1.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10272F7CZ33 110 aa4.75□□□□□ -1.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A1Y7VJH8 109 aa4.67□□□□□ -1.66
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr2gO70558 76 aa4.65□□□□□ -1.66
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1eQ9D139 143 aa4.65□□□□□ -1.67
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa4.64□□□□□ -1.67
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa4.59□□□□□ -1.68
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sprr2dO70555 85 aa4.58□□□□□ -1.68
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11555B1AQ89 175 aa4.56□□□□□ -1.68
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11938Q9D3H4 131 aa4.56□□□□□ -1.68
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11562A0PK51 136 aa4.53□□□□□ -1.68
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1gQ9D195 139 aa4.5□□□□□ -1.69
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce1cQ9D1C5 147 aa4.48□□□□□ -1.69
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Syne1Q6ZWR6 8799 aa4.46□□□□□ -1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa4.45□□□□□ -1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa4.45□□□□□ -1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap4-2B1AQ85 167 aa4.44□□□□□ -1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11596B1AQB0 205 aa4.41□□□□□ -1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A1Y7VLE6 161 aa4.39□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11564A2A4L9 201 aa4.37□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11563B1AQ90 168 aa4.37□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11595B1AQA7 289 aa4.37□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap4-8B1AQA8 209 aa4.37□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mt4P47945 62 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.5 ms