Protein–RNA interactions for Protein: O70555

Sprr2d, Small proline-rich protein 2D, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr2dO70555 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,32□□□□□ -0,6
Sprr2dO70555 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10,94□□□□□ -0,66
Sprr2dO70555 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,84□□□□□ -0,67
Sprr2dO70555 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC10,71□□□□□ -0,69
Sprr2dO70555 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,7□□□□□ -0,7
Sprr2dO70555 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,5□□□□□ -0,73
Sprr2dO70555 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10,24□□□□□ -0,77
Sprr2dO70555 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,23□□□□□ -0,77
Sprr2dO70555 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC10,22□□□□□ -0,77
Sprr2dO70555 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,21□□□□□ -0,78
Sprr2dO70555 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,17□□□□□ -0,78
Sprr2dO70555 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,12□□□□□ -0,79
Sprr2dO70555 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10,1□□□□□ -0,79
Sprr2dO70555 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,09□□□□□ -0,79
Sprr2dO70555 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,07□□□□□ -0,8
Sprr2dO70555 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10,05□□□□□ -0,8
Sprr2dO70555 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10,01□□□□□ -0,81
Sprr2dO70555 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC9,96□□□□□ -0,82
Sprr2dO70555 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,82□□□□□ -0,84
Sprr2dO70555 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC9,8□□□□□ -0,84
Sprr2dO70555 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9,79□□□□□ -0,84
Sprr2dO70555 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,76□□□□□ -0,85
Sprr2dO70555 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,73□□□□□ -0,85
Sprr2dO70555 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC9,72□□□□□ -0,85
Sprr2dO70555 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,71□□□□□ -0,86
Sprr2dO70555 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,7□□□□□ -0,86
Sprr2dO70555 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC9,7□□□□□ -0,86
Sprr2dO70555 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9,64□□□□□ -0,87
Sprr2dO70555 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9,57□□□□□ -0,88
Sprr2dO70555 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC9,56□□□□□ -0,88
Sprr2dO70555 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC9,55□□□□□ -0,88
Sprr2dO70555 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,55□□□□□ -0,88
Sprr2dO70555 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,53□□□□□ -0,88
Sprr2dO70555 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9,52□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,51□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,51□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC9,49□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9,49□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC9,48□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,47□□□□□ -0,89
Sprr2dO70555 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,45□□□□□ -0,9
Sprr2dO70555 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,44□□□□□ -0,9
Sprr2dO70555 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC9,42□□□□□ -0,9
Sprr2dO70555 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9,38□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9,37□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC9,37□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9,35□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,34□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9,34□□□□□ -0,91
Sprr2dO70555 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC9,32□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,29□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,29□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,29□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9,29□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC9,28□□□□□ -0,92
Sprr2dO70555 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,26□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,23□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9,23□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9,22□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC9,22□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,21□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,21□□□□□ -0,93
Sprr2dO70555 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC9,21□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC9,21□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9,19□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,17□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9,16□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,15□□□□□ -0,94
Sprr2dO70555 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,14□□□□□ -0,95
Sprr2dO70555 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC9,13□□□□□ -0,95
Sprr2dO70555 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9,08□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,06□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,06□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9,05□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC9,04□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,04□□□□□ -0,96
Sprr2dO70555 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,02□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9,01□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8,99□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8,99□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,99□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC8,99□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,98□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC8,97□□□□□ -0,97
Sprr2dO70555 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8,95□□□□□ -0,98
Sprr2dO70555 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,94□□□□□ -0,98
Sprr2dO70555 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,92□□□□□ -0,98
Sprr2dO70555 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8,92□□□□□ -0,98
Sprr2dO70555 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8,88□□□□□ -0,99
Sprr2dO70555 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,87□□□□□ -0,99
Sprr2dO70555 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,87□□□□□ -0,99
Sprr2dO70555 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8,87□□□□□ -0,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms