RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data9.5□□□□□ -0.89not detected
BRR1YPR057W ATP12P22135 325 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MSH2P25847 964 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W GDA1P32621 518 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RIM2P38127 377 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W FMP10P40098 244 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BST1P43571 1029 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W FAR3P46671 204 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TRF5P48561 642 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PRP24P49960 444 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W CDC14Q00684 551 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TAF11Q04226 346 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YLR012CQ07927 99 aa9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SPE1P08432 466 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MTF1P14908 341 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data9.49□□□□□ -0.89not detected
BRR1YPR057W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data9.49□□□□□ -0.89not detected
BRR1YPR057W AMD2P22580 549 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SEC14P24280 304 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RPC19P28000 142 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W HEM3P28789 327 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MET22P32179 357 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MVD1P32377 396 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ADD66P36040 267 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MSC7P38694 644 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W STB5P38699 743 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YHI9P38765 294 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SFB3P38810 929 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ASN2P49090 572 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BUD32P53323 261 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BSP1Q06604 576 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YPQ1Q12010 308 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YMR030W-AQ3E760 96 aa9.49□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PHA2P32452 334 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W KAR9P32526 644 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YSC84P32793 468 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PHO89P38361 574 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YHL041WP38730 149 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SEO1P39709 593 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SEC28P40509 296 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W IST3P40565 148 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ARC1P46672 376 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W STR3P53101 465 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TIM13P53299 105 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W COQ6P53318 479 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W GTR1Q00582 310 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RSC4Q02206 625 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RPN4Q03465 531 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SPO71Q03868 1245 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YLR177WQ06251 628 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ADY3Q07732 790 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W LDB18Q07887 179 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ALR1Q08269 859 aa9.48□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RAD3P06839 778 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ERG20P08524 352 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W IDI1P15496 288 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W AAT2P23542 418 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ISF1P32488 338 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TGL4P36165 910 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MRP21P38175 177 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ATG12P38316 186 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ERP5P38819 212 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MEF2P39677 819 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W MAD3P47074 515 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PSP1P50896 841 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W IST1P53843 298 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W DOS2P54858 310 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ADE12P80210 433 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TRS31Q03337 283 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YOR387CQ08910 206 aa9.47□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RNA1P11745 407 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W CLN1P20437 546 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W PEX1P24004 1043 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W SGE1P33335 543 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W KTR4P38131 464 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W RFC3P38629 340 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W YDR089WP38966 869 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W HOS4P40480 1083 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W NUP100Q02629 959 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W YPL109CQ02981 657 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W TVP15Q03860 143 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W YCS4Q06156 1176 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W SYT1Q06836 1226 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W YLR422WQ06409 1932 aa9.46□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W EXO70P19658 623 aa9.45□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W GAL11P19659 1081 aa9.45□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W URK1P27515 501 aa9.45□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W OXP1P28273 1286 aa9.45□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W GCD11P32481 527 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
BRR1YPR057W TOA1P32773 286 aa9.45□□□□□ -0.9
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