RNA–Protein interactions for RNA: YPL066W

RGL1, Transcript of Regulator of Rho1p signaling, cofactor of Tus1p, yeast

Gene RGL1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGL1	YPL066W	PDE1	P22434	369 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	MSS51	P32335	436 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ERV46	P39727	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	POL31	P46957	487 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YNL144C	P53907	740 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	COG6	P53959	839 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ARA2	Q04212	335 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	CRD1	Q07560	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	RRI1	Q12468	440 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	CNA1	P23287	553 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YJL107C	P42947	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PEX14	P53112	341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YNL034W	P53963	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	SCW10	Q04951	389 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	GRS2	Q06817	618 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	NUR1	Q12066	484 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PHO2	P07269	559 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PTC6	P25646	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	GRX4	P32642	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	TFC4	P33339	1025 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YJR120W	P47157	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	YPT11	P48559	417 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RGL1	YPL066W	GSH1	P32477	678 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ARN1	P38731	627 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ERC1	P38767	581 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	MET30	P39014	640 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YGL260W	P53056	76 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ACS1	Q01574	713 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	MLH2	Q07980	695 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	NIC96	P34077	839 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	THI3	Q07471	609 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	AAD4	Q07747	329 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	PAF1	P38351	445 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	AIM6	Q07716	390 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ADH4	P10127	382 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	LAC1	P28496	418 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	SWD1	P39706	426 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YIL169C	P40442	995 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	GSH2	Q08220	491 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	RTT107	P38850	1070 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	UBP7	P40453	1071 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	IMA5	P40884	581 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	UBX6	P47049	396 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	NPA3	P47122	385 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	VPS25	P47142	202 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ASK10	P48361	1146 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	PDR8	Q06149	701 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	MRC1	P25588	1096 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	OCT1	P35999	772 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	UBP8	P50102	471 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	SAD1	P43589	448 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	MCH4	Q08268	501 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	ARP7	Q12406	477 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RGL1	YPL066W	COX1	P00401	534 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	HES1	P35843	434 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	RKM3	P38222	552 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	YOX1	P34161	385 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	VRG4	P40107	337 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	CDC1	P40986	491 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	YGR079W	P53249	370 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	YPR003C	P53394	754 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	PCL6	P40038	420 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	CAB2	P40506	365 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	BET4	Q00618	327 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	SWF1	Q04629	336 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	GTB1	Q04924	702 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	ECI1	Q05871	280 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	PIG1	Q06216	648 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	TOP1	P04786	769 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
RGL1	YPL066W	SKP2	P42843	763 aa		3.25	□□□□□ -1.89

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