RNA–Protein interactions for RNA: YOR252W

TMA16, Transcript of Protein of unknown function that associates with ribosomes, yeast

Gene TMA16, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA16	YOR252W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	SEM1	O94742	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	PRE8	P23639	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	DMC1	P25453	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MRPL9	P31334	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MRP20	P32387	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	UBP16	Q02863	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	RCO1	Q04779	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	GTB1	Q04924	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	ERG8	P24521	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YMC2	P38087	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	TDP1	P38319	544 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	PSD1	P39006	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	BUD16	P39988	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	SDS3	P40505	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	UBX6	P47049	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	VPS4	P52917	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	IMO32	P53219	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	TAF3	Q12297	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MRP7	P12687	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CHS7	P38843	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	ESL1	P40456	1118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	SRB7	P47822	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YGR079W	P53249	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	COG2	P53271	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	AAT1	Q01802	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YML119W	Q03208	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	HUA2	Q12134	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	TPK2	P06245	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	AMD2	P22580	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	TFC3	P34111	1160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MIT1	P40002	666 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	UBP7	P40453	1071 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	DJP1	P40564	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	SIP4	P46954	829 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CPR8	P53728	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	CTF4	Q01454	927 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	WAR1	Q03631	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	YML053C	Q04978	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	SDH5	Q08230	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
TMA16	YOR252W	VCX1	Q99385	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMA16	YOR252W	COX1	P00401	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	STE12	P13574	688 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	CDC15	P27636	974 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GDA1	P32621	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ALY1	P36117	915 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ESL2	P36168	1195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MOH1	P38191	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YBL029W	P38201	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	NPA3	P47122	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YGL117W	P53133	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GND2	P53319	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YNL092W	P53934	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	FCP1	Q03254	732 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	ENT4	Q07872	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	SRB5	P32585	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	OAR1	P35731	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	GEX2	P36173	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	FMP10	P40098	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YSA1	Q01976	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	MUB1	Q03162	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	RAD30	Q04049	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMA16	YOR252W	TAH18	Q12181	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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