RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TMA16	Q08687	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PUS9	Q12069	462 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SUT2	Q12286	268 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	UBP13	P38187	747 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ATG21	Q02887	496 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RTT109	Q07794	436 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	AIM39	Q08223	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	HES1	P35843	434 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NDC80	P40460	691 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SEC15	P22224	910 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	MAK32	P23060	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	BDH2	P39713	417 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ARG7	Q04728	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PMA2	P19657	947 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NPL6	P32832	435 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GMH1	P36125	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ENT4	Q07872	247 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
DSS1	YMR287C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GDA1	P32621	518 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SLZ1	P40167	298 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CDC1	P40986	491 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PMT6	P42934	759 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	INA17	Q02888	182 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ATG23	Q06671	453 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ERG3	P32353	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	APL3	P38065	1025 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ARP1	P38696	384 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	PHM8	P40025	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	LYS14	P40971	790 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SGM1	P47166	707 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SRB7	P47822	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	STB4	P50104	949 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	REG1	Q00816	1014 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	FOB1	O13329	566 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SEC12	P11655	471 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SGF29	P25554	259 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	GIP4	P39732	760 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YJR061W	P40355	935 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	IDS2	P46958	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	BSC5	P53755	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RAD34	Q06665	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RAD16	P31244	790 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MOH1	P38191	138 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	PCL5	P38794	229 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	EXO1	P39875	702 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MSE1	P48525	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MRX6	P48564	524 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	VPS75	P53853	264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	UBP16	Q02863	499 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YCK1	P23291	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	GSH1	P32477	678 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	TDP1	P38319	544 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YFL015C	P43578	164 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YGR079W	P53249	370 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SNT1	P25357	1226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SRB5	P32585	307 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ZAP1	P47043	880 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CTR1	P49573	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SCM3	Q12334	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ISN1	Q99312	450 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	TPK1	P06244	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ABF1	P14164	731 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	GLG1	P36143	616 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YEL057C	P39983	233 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	COQ6	P53318	479 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
DSS1	YMR287C	TRS23	Q03784	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ASE1	P50275	885 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ZDS2	P54786	942 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	GIS1	Q03833	894 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RAD30	Q04049	632 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SWT1	Q12104	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ATG9	Q12142	997 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	GRX6	Q12438	231 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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