RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPH1	Q06160	661 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	OPI10	Q08202	246 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CIR2	Q08822	631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YPR089W	O13585	888 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RDH54	P38086	958 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ERP2	P39704	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SAW1	P39735	261 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	STL1	P39932	569 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SKP2	P42843	763 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RTT102	P53330	157 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SRL4	Q03085	281 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRX10	Q05648	414 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARR1	Q06596	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RSA1	Q08932	381 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TPK2	P06245	380 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FAR1	P21268	830 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YBR259W	P38338	688 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YHR218W	P38899	603 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPA14	P50106	137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SAM37	P50110	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MET13	P53128	600 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RCO1	Q04779	684 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LOT6	Q07923	191 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDC5	P32562	705 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SSO1	P32867	290 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MEF2	P39677	819 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FIR1	P40020	876 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RIC1	P40395	1056 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MOB1	P40484	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	AXL1	P40851	1208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RFX1	P48743	811 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MND1	P53102	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	COG5	P53951	403 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CSN9	Q03981	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDA1	Q06702	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TAF3	Q12297	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GTT2	Q12390	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-C	P25384	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PBS2	P08018	668 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	URA4	P20051	364 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATG12	P38316	186 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PHO89	P38361	574 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YHR202W	P38887	602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NUP82	P40368	713 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PAC11	P40960	533 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPC105	P53148	917 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YET3	Q07451	203 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RGS2	Q99188	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MET17	P06106	444 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KSS1	P14681	368 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARG8	P18544	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPS22	P25380	463 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	OXP1	P28273	1286 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CHS3	P29465	1165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UIP5	P36137	443 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GLG1	P36143	616 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRPL36	P36531	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YHL012W	P38709	493 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TIM54	P47045	478 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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