RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	ZAP1	P47043	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	UBX6	P47049	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	ATG16	Q03818	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KAR5	YMR065W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	MBR1	P23493	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PTP1	P25044	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	URK1	P27515	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YBR138C	P38277	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	NPR3	P38742	1146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	NPA3	P47122	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	COX1	P00401	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	NUP120	P35729	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ERC1	P38767	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	LTP1	P40347	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SNO3	P43544	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	TAM41	P53230	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	GTB1	Q04924	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	FRE7	Q12333	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YCL049C	P25577	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PTC6	P25646	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	LAC1	P28496	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	FTH1	P38310	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YGR079W	P53249	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	CIA1	Q05583	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SAP185	P40856	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SMK1	P41808	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ERR3	P42222	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	IRC7	P43623	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ATG23	Q06671	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PSR2	Q07949	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	MAK32	P23060	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	HES1	P35843	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	XRS2	P33301	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	BUD16	P39988	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	DJP1	P40564	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	CIN1	P40987	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	NET1	P47035	1189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	IES5	P40060	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	RSC9	Q03124	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	STP3	Q05937	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SWT1	Q12104	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	COX17	Q12287	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SSM4	P40318	1319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	MTF2	P10849	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	SPO16	P17122	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	RAD16	P31244	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	YGR021W	P53212	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	BAG7	Q12128	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR5	YMR065W	TPK1	P06244	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
KAR5	YMR065W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	MSS51	P32335	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	GSH1	P32477	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	UME6	P39001	836 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	MSY1	P48527	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	ORC5	P50874	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	COG1	P53079	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	PSY4	P38193	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	FUI1	P38196	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	IFA38	P38286	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	THI3	Q07471	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	AFT2	Q08957	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	COQ3	P27680	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KAR5	YMR065W	STP1	Q00947	519 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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