RNA–Protein interactions for RNA: YML118W

NGL3, Transcript of 3'-5' exonuclease specific for poly-A RNAs, yeast

Gene NGL3, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NGL3	YML118W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PGC1	Q08959	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SOD2	P00447	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
NGL3	YML118W	VPS34	P22543	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MNE1	P24720	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ADK2	P26364	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PES4	P39684	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	NUP60	P39705	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RGI2	P40188	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	FKH2	P41813	862 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RFX1	P48743	811 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GLO1	P50107	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SNO2	P53823	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CIK1	Q01649	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	URK1	P27515	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GPI10	P30777	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MDL1	P33310	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	UBP13	P38187	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	FMO1	P38866	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YEL057C	P39983	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	JHD1	P40034	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PIG2	P40187	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YIL166C	P40445	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MET18	P40469	1032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	BAP3	P41815	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SGF73	P53165	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YAP6	Q03935	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CRF1	Q04930	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	DUS4	Q06063	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RXT3	Q07458	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PRP28	P23394	588 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	STE50	P25344	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	KAR4	P25583	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	AAD3	P25612	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	POL4	P25615	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YCR061W	P25639	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GCS1	P35197	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GEX2	P36173	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	REG2	P38232	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SMF1	P38925	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MEF2	P39677	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	BUD16	P39988	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	BRF1	P29056	596 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	UBP11	P36026	717 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MAL33	P38157	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YIR042C	P40586	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	JJJ1	P53863	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	AIM32	Q04689	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	TCO89	Q08921	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	RIM20	Q12033	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SWT1	Q12104	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	CLB3	P24870	427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	STB6	P36085	766 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PLB1	P39105	664 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	MET28	P40573	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	IME4	P41833	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SSU1	P41930	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	AMA1	P50082	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	LCL3	P53153	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ERG5	P54781	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YEH1	Q07804	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	NTH1	P32356	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	POP2	P39008	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YJL206C	P39529	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	LCB2	P40970	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	GPI8	P49018	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	YGR066C	P53242	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NGL3	YML118W	PEX25	Q02969	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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