RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	BDH2	P39713	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YIL054W	P40524	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CFD1	P40558	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SPG5	P42933	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RTS3	P53289	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	HST1	P53685	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YNL108C	P53929	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SUR7	P54003	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	INA17	Q02888	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TRS23	Q03784	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	BSC6	Q08280	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	THI21	Q08975	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	AFI1	Q99222	893 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	AIM26	P32858	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YET1	P35723	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MRPL37	P36532	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	IML3	P38265	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TIM17	P39515	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ERP2	P39704	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YAL037W	P39728	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YEL028W	P39989	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SAP185	P40856	1058 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SPC105	P53148	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
ATG33	YLR356W	VAC7	P53950	1165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	DOS2	P54858	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	BET4	Q00618	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	VHS1	Q03785	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ERV41	Q04651	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MCP2	Q06567	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GUP2	Q08929	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YCR006C	P25350	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	LDB16	P25587	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SPR1	P32603	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SCD5	P34758	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PIM1	P36775	1133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CHS7	P38843	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RRT5	P43607	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YJL132W	P47014	750 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TCB2	P48231	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SWC4	P53201	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CDC55	Q00362	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RKM2	Q03942	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CDA2	Q06703	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SWC7	Q06707	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PLB3	Q08108	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ATG33	YLR356W	IZH4	Q99393	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YPR089W	O13585	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PRI2	P20457	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	GSY2	P27472	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SMC1	P32908	1225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TFC3	P34111	1160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TAF14	P35189	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PHO11	P35842	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	PHO12	P38693	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YHL041W	P38730	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	CEM1	P39525	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	RPH1	P39956	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TMN3	P40071	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SLX8	P40072	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	HXT8	P40886	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ZIM17	P42844	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	SIP4	P46954	829 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	COG1	P53079	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YGR111W	P53265	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YNL143C	P53908	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	TGL2	P54857	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	VID22	Q05934	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG33	YLR356W	GYP1	Q08484	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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