RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	PRP28	P23394	588 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	KAR4	P25583	335 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	URK1	P27515	501 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	RXT2	P38255	430 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	FMO1	P38866	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SLZ1	P40167	298 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YIR042C	P40586	236 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GLO1	P50107	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	INN1	P53901	409 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YML119W	Q03208	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MNE1	P24720	663 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YCR061W	P25639	631 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GEX2	P36173	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SRO77	P38163	1010 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	UBP13	P38187	747 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	PLB1	P39105	664 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YEL057C	P39983	233 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	JHD1	P40034	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YIL166C	P40445	542 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MET18	P40469	1032 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	AMA1	P50082	593 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YAP6	Q03935	383 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CRF1	Q04930	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	PGC1	Q08959	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SWT1	Q12104	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	STE50	P25344	346 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	POL4	P25615	582 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MDL1	P33310	695 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MAL33	P38157	468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	REG2	P38232	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SMF1	P38925	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	BUD16	P39988	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ICP55	P40051	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SGF73	P53165	657 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	JJJ1	P53863	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ERG5	P54781	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MCA1	Q08601	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	TCO89	Q08921	799 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	RIM20	Q12033	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GPI10	P30777	616 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	NTH1	P32356	751 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GCS1	P35197	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	UBP11	P36026	717 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YJL206C	P39529	758 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	PES4	P39684	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MET28	P40573	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	IME4	P41833	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SSU1	P41930	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GCN5	Q03330	439 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SKG3	Q06315	1026 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ATG23	Q06671	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YEH1	Q07804	573 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	FRE5	Q08908	694 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
RPS0B	YLR048W	CLB3	P24870	427 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	CDC20	P26309	610 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SRB5	P32585	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	STB6	P36085	766 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MPS3	P47069	682 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YGR066C	P53242	292 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	AIM32	Q04689	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	GTB1	Q04924	702 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	IZH3	Q07959	543 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YOR019W	Q99248	730 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	TRP3	P00937	484 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	BRF1	P29056	596 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	MRPL7	P36519	292 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	VID24	P38263	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0B	YLR048W	SKN7	P38889	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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