RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	PET122	P10355	254 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	BIK1	P11709	440 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	YJR008W	P47085	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	GLO1	P50107	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	UBX4	P54730	416 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	URK1	P27515	501 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	ACA1	P39970	489 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	PUG1	P40100	303 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	CIN1	P40987	1014 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	SKP2	P42843	763 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	TAM41	P53230	385 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	YGR079W	P53249	370 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	IOC4	Q04213	475 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	COX1	P00401	534 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	CLB4	P24871	460 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	PTC6	P25646	442 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	LAC1	P28496	418 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	YBR138C	P38277	524 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	UBX6	P47049	396 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	GTB1	Q04924	702 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	CRC1	Q12289	327 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YCT1	YLL055W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	HES1	P35843	434 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SNM1	P40993	198 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ICT1	Q12385	394 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MSM1	P22438	575 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	COQ3	P27680	312 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	GSH1	P32477	678 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	TMT1	P32643	299 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	BUD16	P39988	312 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	TPM2	P40414	161 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ERV46	P39727	415 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	JHD1	P40034	492 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	UBP7	P40453	1071 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	GAT1	P43574	510 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ZAP1	P47043	880 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SEC5	P89102	971 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	RGT2	Q12300	763 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MRPL36	P36531	177 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YIL024C	P40543	189 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MNT3	P40549	630 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	CFD1	P40558	293 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ORC5	P50874	479 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ATG23	Q06671	453 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	THI3	Q07471	609 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YAP7	Q08182	245 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MSS51	P32335	436 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	NPR3	P38742	1146 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	PSF2	P40359	213 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	DJP1	P40564	432 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ERR3	P42222	437 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MSY1	P48527	492 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	CIA1	Q05583	330 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	BLS1	Q06071	122 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	BAG7	Q12128	409 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	NUC1	P08466	329 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YCL049C	P25577	312 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	NUP120	P35729	1037 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YPR003C	P53394	754 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	STP3	Q05937	343 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	PFA4	Q12006	378 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	PTH2	P34222	208 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ARN1	P38731	627 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SPC97	P38863	823 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	PCI8	P40512	444 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YJL107C	P42947	387 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	GEP3	Q08622	556 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SWT1	Q12104	458 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	YPR089W	O13585	888 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	GAL4	P04386	881 aa		3.46	□□□□□ -1.85
YCT1	YLL055W	SPO16	P17122	198 aa		3.46	□□□□□ -1.85

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