RNA–Protein interactions for RNA: YLL037W

YLL037W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YLL037W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL037W	YLL037W	HER1	Q12276	1246 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL037W	YLL037W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	PTC6	P25646	442 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YKL133C	P36066	463 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	FLO5	P38894	1075 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	SIR1	P21691	654 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MGM1	P32266	881 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	GSH1	P32477	678 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ERC1	P38767	581 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ERV46	P39727	415 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	CAB2	P40506	365 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	IRC8	P47046	822 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	NPA3	P47122	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	GAL4	P04386	881 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	GRX7	P38068	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ORC5	P50874	479 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ARA2	Q04212	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	COX1	P00401	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	GAL1	P04385	528 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	POL3	P15436	1097 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	APM3	P38153	483 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	UBP7	P40453	1071 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	HIS6	P40545	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MET14	Q02196	202 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ATG21	Q02887	496 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	PFA4	Q12006	378 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	RIT1	P23796	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	LAC1	P28496	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	YJL107C	P42947	387 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	QRI7	P43122	407 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	HIM1	Q06674	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MSS51	P32335	436 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	HES1	P35843	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	PXL1	P36166	706 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	UBX6	P47049	396 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	SCS3	P53012	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	MLC2	Q06580	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	ATX2	Q12067	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	RRI1	Q12468	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL037W	YLL037W	PIF1	P07271	859 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	MSH1	P25846	959 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	URK1	P27515	501 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	SCO2	P38072	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	ARN1	P38731	627 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YGR079W	P53249	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YPR003C	P53394	754 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	VTC3	Q02725	835 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	THI3	Q07471	609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	SUL2	Q12325	893 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	PEP1	P32319	1579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	HIR3	P47171	1648 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	MSS18	P08593	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	CNA1	P23287	553 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	PTP2	P29461	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	SKP2	P42843	763 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	MDV1	P47025	714 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YLL037W	YLL037W	LTE1	P07866	1435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	PET122	P10355	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	YIR016W	P40572	265 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLL037W	YLL037W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms