RNA–Protein interactions for RNA: YKL177W

YKL177W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL177W, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL177W	YKL177W	SWT1	Q12104	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	VCX1	Q99385	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	STE4	P18851	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PRE8	P23639	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PGS1	P25578	521 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	GEX2	P36173	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PCL5	P38794	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	NDC80	P40460	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	TRS23	Q03784	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	RAD30	Q04049	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	MFB1	Q04922	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	GTB1	Q04924	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	ATG23	Q06671	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SCM3	Q12334	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	LAM4	P38800	1345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	GCN4	P03069	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YBL029W	P38201	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	NPR2	P39923	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	UBP7	P40453	1071 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	AAD10	P47182	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	CTR1	P49573	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	IMO32	P53219	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	MDG1	P53885	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	FCP1	Q03254	732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	TAF11	Q04226	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YCK1	P23291	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	TFC3	P34111	1160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	GMH1	P36125	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YPT10	P38146	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YHL017W	P38745	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PIH1	P38768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	UBP5	P39944	805 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PMT6	P42934	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YGR079W	P53249	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SPC98	P53540	846 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	MUB1	Q03162	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	AAC1	P04710	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	GLG1	P36143	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	FLC2	P39719	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	SLZ1	P40167	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YKL177W	YKL177W	RMD8	P43620	662 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	KIN4	Q01919	800 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	CRT10	Q08226	957 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKL177W	YKL177W	AMD2	P22580	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	SIP1	P32578	815 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	SRB5	P32585	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	TRM2	P33753	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	RTS1	P38903	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	MAM1	P40065	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	DJP1	P40564	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	MRX6	P48564	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	DSD1	P53095	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	YNR061C	P53747	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	VPS75	P53853	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	INN1	P53901	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	YNL092W	P53934	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	YML119W	Q03208	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	ARP9	Q05123	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YKL177W	YKL177W	RCN2	Q12044	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	NMD4	Q12129	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKL177W	YKL177W	ARG3	P05150	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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