RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	LSB6	P42951	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LCL3	P53153	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ACS1	Q01574	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SMA1	Q02651	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	ARR1	Q06596	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	AAD4	Q07747	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RSB1	Q08417	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	GPB1	Q08886	897 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CTF3	Q12748	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YLR302C	O13544	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CDC42	P19073	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	NFS1	P25374	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	KDX1	P36005	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PXL1	P36166	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	PIH1	P38768	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RGI2	P40188	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MET28	P40573	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MLC1	P53141	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	REG1	Q00816	1014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	YPS7	Q06325	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RIM20	Q12033	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SWT1	Q12104	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	UBX3	Q12229	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	RBD2	Q12270	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKS1	YJL057C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	BIK1	P11709	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RTG1	P32607	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SEC61	P32915	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	UBP11	P36026	717 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TPO5	P36029	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	THI2	P38141	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	STN1	P38960	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YIL089W	P40500	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ASE1	P50275	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	COG1	P53079	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ORC4	P54791	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MEC3	Q02574	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RCO1	Q04779	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	HMI1	Q12039	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	NBP2	Q12163	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PRE8	P23639	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YBL029W	P38201	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GIP4	P39732	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YER158C	P40095	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YFL054C	P43549	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YJL181W	P46987	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GLO1	P50107	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YIG1	Q08956	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	LDB17	Q12342	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	KOG1	P38873	1557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PRD1	P25375	712 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SLX1	P38324	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	FET4	P40988	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MNT4	P53745	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RCM1	P53972	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TRI1	Q05024	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	URA3	P03962	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SRB4	P32569	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SEF1	P34228	1148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	CST26	P38226	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RRT2	P38332	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	GIC1	P38785	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	MNL1	P38888	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	RRT14	P40470	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	DOT5	P40553	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKS1	YJL057C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms