RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT13	P39924	564 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RMR1	P53060	241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT17	P53631	564 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MNT4	P53745	580 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AQR1	P53943	586 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RCM1	P53972	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT15	P54854	567 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VPS74	Q06385	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YIG1	Q08956	461 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YAK1	P14680	807 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ERV1	P27882	189 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT1	P32465	570 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SCD5	P34758	872 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YRO2	P38079	344 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YBR287W	P38355	427 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	REV7	P38927	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CAB2	P40506	365 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MNT2	P53059	558 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YGR012W	P53206	393 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RSN1	Q03516	953 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MSC3	Q05812	728 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HFI1	Q12060	488 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PSF3	Q12146	194 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SEC62	P21825	274 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PER1	P25625	357 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SEC65	P29478	273 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	OAF3	P36023	863 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT7	P39004	570 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CHS6	P40955	746 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RGD2	P43556	714 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PET117	Q02771	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VPS38	Q05919	439 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CBS1	P14066	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GEX1	P25596	615 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	UTR2	P32623	467 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DYS1	P38791	387 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BZZ1	P38822	633 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SMF1	P38925	575 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AGE2	P40529	298 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YIR042C	P40586	236 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	IAH1	P41734	238 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GIM5	Q04493	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ECM30	Q06673	1274 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TLG2	Q08144	397 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SWT1	Q12104	458 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MSN1	P22148	382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	HXT4	P32467	576 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DCW1	P36091	449 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MAL32	P38158	584 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SRO77	P38163	1010 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	APD1	P38281	316 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MSC7	P38694	644 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SHC1	P39000	512 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	EAF5	P39995	279 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RRN7	P40992	514 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SNX4	P47057	423 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MAL12	P53341	584 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ORC4	P54791	529 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ATG17	Q06410	417 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DCI1	Q08558	271 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MET7	Q08645	548 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YPL066W	Q12194	479 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ADH4	P10127	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RAP1	P11938	827 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RSR1	P13856	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ATP12	P22135	325 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87

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