RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	YNR061C	P53747	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VID22	Q05934	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PSF3	Q12146	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RAV1	P47104	1357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PPE1	P38796	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TOF1	P53840	1238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ECM11	Q04110	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
LEU1	YGL009C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	LTE1	P07866	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ADH4	P10127	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	FPS1	P23900	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MSN4	P33749	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	OSH7	P38755	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MNL1	P38888	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	DUN1	P39009	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NPR2	P39923	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PIB2	P53191	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	DON1	Q05610	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SLP1	Q12232	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MET17	P06106	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	KSS1	P14681	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	HXT4	P32467	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TGL1	P34163	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	COS111	P38308	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YBR225W	P38321	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RFC3	P38629	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SMF2	P38778	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PUG1	P40100	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VID28	P40547	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MLC1	P53141	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TNA1	P53322	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	HDA1	P53973	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ECM18	Q04623	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CIR2	Q08822	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	THI21	Q08975	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SKS1	Q12505	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	APE1	P14904	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YSC84	P32793	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MRX1	P40050	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RRT14	P40470	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TEL2	P53038	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VPS9	P54787	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ARP4	P80428	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SRC1	Q03707	834 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MFB1	Q04922	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SRN2	Q99176	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MET5	P47169	1442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CDC16	P09798	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CKA1	P15790	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	STE50	P25344	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ADP1	P25371	1049 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MGM1	P32266	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	BCK2	P33306	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	STE13	P33894	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MTG2	P38860	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YIR042C	P40586	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SHR5	P41912	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YFL052W	P43551	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34 ms